当前解析结果
SmilChr01G000444| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000444 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000444 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000444 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 9018391 - 9018735 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131015525 |
|---|---|
| GeneID | 131015525 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131015525 |
| 原始查询 | LOC131015525 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131015525 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057799953.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057799953.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057799953.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057799953.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057799953.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:9018402 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 35 | A11,A14,A19,A21,A7,B102,B109,B14,B20,B32,B40,B46,B53,B73,B93,B94,B99,C11,C16,C17,C20,C27,C3,C31,C33,C4,C41,C42,C51,C52,C56,C65,C69,C82,D7 |
Chr1:9018412 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B25,B28,C11,C3,C83 |
Chr1:9018423 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C12 |
Chr1:9018433 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B133,B31,B4,D9 |
Chr1:9018441 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 5 | A9,B103,B107,B25,B31 |
Chr1:9018441 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A9,B103,B107,B25,B31 |
Chr1:9018457 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B108,B122,B58,B71 |
Chr1:9018465 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 17 | A16,A19,A6,B108,B126,B27,B35,B80,C2,C20,C23,C70,C78,C81,C84,D4,D9 |
Chr1:9018493 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A18,C76 |
Chr1:9018496 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B104,B56,B98,C48 |
Chr1:9018501 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A1,B3,B4,B41,B78 |
Chr1:9018511 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B35,C23 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。