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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004694`

染色体: Chr03 坐标: 64295450-64296685 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004694`
名称	SmilChr03G004694
描述	probable carboxylesterase 17
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	64295450 - 64296685 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015536`
GeneID	`131015536`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015536`
原始查询	`LOC131015536`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable carboxylesterase 17
产物	probable carboxylesterase 17
Arabidopsis	`AT5G16080` (CXE17) carboxyesterase 17 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831465] identity=37.7; qcov=1.07; evalue=7.7e-63; confidence=medium
Rice	`Os07g0162400` (OsCDAP1) - identity=39; qcov=1.02; evalue=2.32e-56; confidence=medium
GO	GO:0016787 (hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00135 (COesterase); PF07859 (Abhydrolase_3); PF20434 (BD-FAE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015536

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057799928.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057799928.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799928.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799928.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799928.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:64295675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,C63
`Chr3:64295709`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	26	A18,A20,A24,B102,B105,B123,B125,B131,B132,B14,B28,B31,B36,B40,B55,B60,B72,B89,C42,C55,C62,C64,C66,C67,C75,C83
`Chr3:64295727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C59
`Chr3:64295738`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B17,C30
`Chr3:64295738`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B17,C30
`Chr3:64295752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr3:64295873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr3:64295887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C44
`Chr3:64295925`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr3:64295937`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C15
`Chr3:64295995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B120,B124,B40,B53
`Chr3:64296003`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799928.1

298 aa

149

298

COesterase

BD-FAE

Abhydrolase_3

PF00135 COesterase 48-160 aa PF20434 BD-FAE 54-159 aa PF07859 Abhydrolase_3 64-275 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799928.1`	Pfam	`PF00135`	COesterase	Domain	48	160	2.6e-08	34.0	Carboxylesterase family
`XP_057799928.1`	Pfam	`PF20434`	BD-FAE	Domain	54	159	1.5e-12	48.2	BD-FAE
`XP_057799928.1`	Pfam	`PF07859`	Abhydrolase_3	Domain	64	275	6.9e-53	180.2	alpha/beta hydrolase fold

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943945.1
TTACTCCTCAAAAAAATAAATTAAAAAAGAATAATAATCCCTATCTCTTCAGTCTTCATCATACAACATGTTTTCTCTCATGAAATCCACATGCATCGCCAGCATCCAACCTATAATTAATTAACTAATCTCTCCCTTAATCACACCAAACTCCAATCTTCCTTAATCAAAACCTCTCATAAATCAAAGCACTCCACAAATCTACAATCTCACACCAATCAAATTAACTTAAACACCTTAGTTAATCCCCCTCTAAACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015536
ATGTCGCTAATCGCGGAGGCGCCGCGCTTCCTCCAAGTCTTCTCCGACGGCTCCGTCGTCCGCGCCGCCCACCAAACCGCCGCGTGCTCCGCCACCTCCAAGGACGTCACCGTCGACCCCTCGAAGCCCATCACCGCCCGAATCTTCCTCCCCGCCGCCCCCTCCGCCTCCACGCCGCCGCTCCCAGTGCTCGTCTACTTCCACGGCGGCGGCTTCTGCATCGGCACCACCACGTGGCTCGGCTACCACCACTTCCTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799928.1
MSLIAEAPRFLQVFSDGSVVRAAHQTAACSATSKDVTVDPSKPITARIFLPAAPSASTPPLPVLVYFHGGGFCIGTTTWLGYHHFLENLSAAAGAIVLSVDYRLAPENKLPAAYDDGSAALEWLSGAGAGEPWLRNADLSRVFLAGDSAGGNIAHHLAVNFAGGGNFPANIPIRGILPIHPYFGAEAPTEGERAAGAMNDMFWKLSLPEGADRDSYGCNFESAEAEWGLFPATAVFVAGLDFLRERGVMYADFLKKKGVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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