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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004706`

染色体: Chr03 坐标: 64341994-64343642 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004706`
名称	SmilChr03G004706
描述	glycosyltransferase BC10
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	64341994 - 64343642 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015546`
GeneID	`131015546`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015546`
原始查询	`LOC131015546`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycosyltransferase BC10
产物	glycosyltransferase BC10
Arabidopsis	`AT5G25330` (AT5G25330) Core-2/I-branching beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832605] identity=48.5; qcov=1.01; evalue=3.99e-125; confidence=high
Rice	`Os12g0618800` (OsPLS3) - identity=45.3; qcov=0.884; evalue=3.63e-84; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02485 (Branch)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015546

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057799945.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799945.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799945.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799945.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057799945.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:64342548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B13,B84,C70,C81
`Chr3:64342578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B128,B27,C10,C30
`Chr3:64342581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:64342681`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr3:64342716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,C1
`Chr3:64342720`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr3:64342754`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	22	A18,A19,A4,A7,B136,B2,B22,B24,B64,B73,B78,B87,B88,B93,C11,C21,C39,C41,C69,C71,C75,C80
`Chr3:64342759`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr3:64342803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr3:64342860`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B98
`Chr3:64342860`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B98
`Chr3:64342914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B92

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799945.1

397 aa

198

397

Branch

PF02485 Branch 114-342 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799945.1`	Pfam	`PF02485`	Branch	Family	114	342	9.5e-61	206.2	Core-2/I-Branching enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943962.1
GTCTTTACACACCACAAAATGCGATACAACTTGTGACCTCAAATACCATTATCCAAACATATCATATTATCCTTCTTGAAATTGAAAAAGATAAATAAATATTAATGTGCACTTAATTAATAGGAAGTAGTACAATACTAAACACAAAATCCCAAACTCCAAAACAATAATCAATACTTTTGAAAATACTAGTCTTTTCCATTAATGTTTTTTTGTTTACAAACTCATTTTGGCTGCTCGTAATTACTCTCATTTATTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015546
ATGCTGCCCCCCACCCCCCTCTCCCTCCTCTGCGCCATCCTCCTCTGCCTCCCCCTCGCCGTCATCTTCACTTTCACCGCCCCTACCTCCACCACCTCCGCCGCCGCCGGAGGCGGCGCCGCCATTTCCCCACTCCCTATCACTATAACTCCCACTCCAACTAAAAGAAGCCTTGCTCCAACAACAACACTTCTACACCCCAACAGCAAGAACCTCACCACGGCGGCGGCGGCAAATTATACGCCGCCGCGGGCTCCGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799945.1
MLPPTPLSLLCAILLCLPLAVIFTFTAPTSTTSAAAGGGAAISPLPITITPTPTKRSLAPTTTLLHPNSKNLTTAAAANYTPPRAPPAEDEAEDQALFNLASRVDPTPRPVKKVAFMFLATTALPLAPLWELFFSPAAAGRYNVYVHAAANYSGAFANRTIPSGPTRRHTPSLIAAARRLLAHALLDDGANAMFALLSPSCAPLHSFSYTHRVLTRSRRSFVEILRGEPGARERWAARGEDAMLPEVGYDDFRIGSQFWV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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