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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004722`

染色体: Chr03 坐标: 64430510-64433604 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004722`
名称	SmilChr03G004722
描述	vesicle-associated membrane protein 711
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	64430510 - 64433604 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015561`
GeneID	`131015561`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015561`
原始查询	`LOC131015561`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vesicle-associated membrane protein 711
产物	vesicle-associated membrane protein 711
Arabidopsis	`AT5G11150` (VAMP713) vesicle-associated membrane protein 713 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830984] identity=77.3; qcov=1; evalue=9.83e-135; confidence=high
Rice	`Os06g0174400` (OsVAMP7111) - identity=73.6; qcov=1; evalue=5.64e-122; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0016192 (vesicle-mediated transport)
KEGG	smil04130 (SNARE interactions in vesicular transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00957 (Synaptobrevin); PF13774 (Longin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015561

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	1.00000	`XP_057799972.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057799972.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057799972.1`
4	Vesicle	囊泡	0.80000	`XP_057799972.1`
5	Endosome	内体	0.60000	`XP_057799972.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:64430836`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B85,C82
`Chr3:64430892`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr3:64433401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr3:64433425`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B56
`Chr3:64433425`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799972.1

219 aa

110

219

Longin

Synaptobrevin

PF13774 Longin 15-111 aa PF00957 Synaptobrevin 126-205 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799972.1`	Pfam	`PF13774`	Longin	Domain	15	111	3.7e-27	95.1	Regulated-SNARE-like domain
`XP_057799972.1`	Pfam	`PF00957`	Synaptobrevin	Domain	126	205	6.3e-29	100.4	Synaptobrevin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943989.1
ACACGCGTTTGTCCATGTCAGTAAAAGCGCTTCTTCCTTGAAGCGCTTATCTCCGAAATTGCAGGGATGAATCCGTCGTTTTCTCTCTTTTGACGTGATTAGTATTTCATCAATCAAGGCAGGCAGCATTTGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGGGGGGATGACGATACTTTACGCGCTGGTGGCGCGTGGCTCGGTCGTGCTGGCGGAATACAGCGCTACTTCCACCACGGCGAATGCGATCGCGCGTCAAATTCTCGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015561
ATGACGATACTTTACGCGCTGGTGGCGCGTGGCTCGGTCGTGCTGGCGGAATACAGCGCTACTTCCACCACGGCGAATGCGATCGCGCGTCAAATTCTCGAAAAAATCCCCGGTAACAATGATACCAACGCTTCATACTCGCAGGATCGCTACATTTTTCACGTCAAACGCACCGATGGCCTCACCGTCCTCTGTATGGCCGACGACACCGCCGGAAGGCGAATTCCTTTTGCGTTTCTCGAAGAAATTCATCAAAGATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799972.1
MTILYALVARGSVVLAEYSATSTTANAIARQILEKIPGNNDTNASYSQDRYIFHVKRTDGLTVLCMADDTAGRRIPFAFLEEIHQRFVRTYGRAVLSAQPYAMNDEFSRVLSQQMEYFSSDPNADRINRLKGEMSQVRNVMIENIDKVLDRGDRLELLVDKTATMQGNTFRFRKQARRFRSNVWWRNVKLTIALIFLLLVIIYVVLAFVCHGPTLPSCL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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