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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G004727`

染色体: Chr03 坐标: 64452564-64458642 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G004727`
名称	SmilChr03G004727
描述	synaptotagmin-4-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	64452564 - 64458642 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015567`
GeneID	`131015567`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015567`
原始查询	`LOC131015567`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	synaptotagmin-4-like
产物	synaptotagmin-4-like
Arabidopsis	`AT1G05500` (NTMC2T2.1) Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837052] identity=68.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0409100` (OsNTMC2T4.1) - identity=39; qcov=0.774; evalue=4.72e-100; confidence=medium
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0008289 (lipid binding)
KEGG	-
Pfam	PF00168 (C2); PF17047 (SMP_LBD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015567

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057799976.1`
2	Endosome	内体	0.20000	`XP_057799976.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799976.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799976.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057799976.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:64452795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:64454751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr3:64454952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B41
`Chr3:64455402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B99,C11
`Chr3:64455408`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,D11
`Chr3:64455426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,B95,D11
`Chr3:64455441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C60,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799976.1

563 aa

282

563

SMP_LBD

PF17047 SMP_LBD 70-248 aa PF00168 C2 262-366 aa PF00168 C2 439-532 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799976.1`	Pfam	`PF17047`	SMP_LBD	Domain	70	248	7.4e-16	58.9	Synaptotagmin-like mitochondrial-lipid-binding domain
`XP_057799976.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	262	366	4.4e-52	175.4	C2 domain
`XP_057799976.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	439	532	4.4e-52	175.4	C2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943993.1
ATCCATTCGGACAACGTTCTCGATTGCTTCGGAAATCAAGAATTATTCATCCAAATTTTTTCAGGGATTCAATCCCACGTAACAAAGTCAAATAAATTCTCTTCTGCACATTGAATCAACACTGTTGAATTATACTTCCTCCACCACATTCAAACTCAAGCACAAGAAGAAAAAAAAAGATTTTTTCTGCACAAGATGGGATTTTTCCTAGGTTACTTTCTGGGTTTTGCGGTTGCCTTCGGATTGATCGTGGGATTCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015567
ATGGGATTTTTCCTAGGTTACTTTCTGGGTTTTGCGGTTGCCTTCGGATTGATCGTGGGATTCGCGAAATACCAGAATCTCAGATCCAAAAAACGCACCGATTTGGCAGCAGCAATAGCGGCATTGGCTCGAATAACTGTCCAAGATTCGAGGAAGCTTCTCCCAGATAAATTCTACCCTTCTTGGATTGTCTTTTCACAGAGGCAGAAGTTAAACTGGCTTAATCAGCACCTAGACAAAATATGGCCTTATGTTGACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799976.1
MGFFLGYFLGFAVAFGLIVGFAKYQNLRSKKRTDLAAAIAALARITVQDSRKLLPDKFYPSWIVFSQRQKLNWLNQHLDKIWPYVDQAASQVIRESVEPILEQYRPAILASLKFSTLTLGTVAPQFTGVAILDSEPNEIVMELDMQWDGNPDIVLEIKTRVGVALPIQVKNIGFTGVFRLIFKPLVDEFPCFGAVCFSLREKRNLDFTLKVIGGDLSSIPGISDAIEGTIRDAIEDSITWPVRKIIPILPGDYSYLEVKP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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