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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001677`

染色体: Chr03 坐标: 22022676-22027164 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001677`
名称	SmilChr03G001677
描述	uncharacterized SmilChr03G001677
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	22022676 - 22027164 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015613`
GeneID	`131015613`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015613`
原始查询	`LOC131015613`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsWD40-13; symbol=OsWD40-13; hit=Os01g0322800; species=rice; confidence=medium
产物	OsWD40-13; symbol=OsWD40-13; hit=Os01g0322800; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G73720` (SMU1) transducin family protein / WD-40 repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843707] identity=86.2; qcov=0.479; evalue=6.22e-43; confidence=medium
Rice	`Os01g0322800` (OsWD40-13) - identity=91.2; qcov=0.479; evalue=2.13e-46; confidence=medium
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006535 (GO:0006535); GO:0009001 (L-serine O-acetyltransferase activity); GO:0071011 (precatalytic spliceosome)
KEGG	-
Pfam	PF06426 (SATase_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015613

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057800037.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057800038.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057800037.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057800037.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800037.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:22023252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr3:22023257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B133
`Chr3:22023258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,C23,C29
`Chr3:22023259`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B73,C50,C8
`Chr3:22023262`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr3:22023264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,C60
`Chr3:22023290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,D1
`Chr3:22023307`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B34,C85
`Chr3:22023307`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B34,C85
`Chr3:22023329`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A21,A25,B121,B126,B2,B28,B4,B44,B5,B62,B85,C16,C18,C45,C67,C73,C78,C80
`Chr3:22023336`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B122,B50,B57,C23
`Chr3:22023336`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B122,B50,B57,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800037.1

175 aa

175

SATase_N

PF06426 SATase_N 43-84 aa

XP_057800038.1

167 aa

167

SATase_N

PF06426 SATase_N 43-84 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800037.1`	Pfam	`PF06426`	SATase_N	Domain	43	84	2.3e-07	31.8	Serine acetyltransferase, N-terminal
`XP_057800038.1`	Pfam	`PF06426`	SATase_N	Domain	43	84	2e-07	32.0	Serine acetyltransferase, N-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009098595.1
GGAAATGCAAGTGATTGCAGGTTTCTTGTGTCTTTAGCAGAAATTCTCCATTGCAATTCCAAGCTCTACTGGAATGATTACATCTTTAAGGCAAACCCAGGTGATGGGTGTCATGAAACAGGAGCAACCAGAGAGATACTTACGGCTTGAGCATCTACTGGTTCGGACTTACTTTGACCCAAATGAGGTGTATCAAGACTCTACAAAGGAGAAAAGACGTGCTCAAATAGCCCAAGCTGTTGCGGCTGAAGTTTCAGTAG...

XM_057944054.1
ATTAGCATGTTTTTATAACGGTTGCTTTTACCGTTATATATGAGCGCCTCAATCTGTTATGTATAATTATTTTTTTTAATATCATTTAAATAAATTGAAGTAAATAATTGTTGGTATGAATTTTTATCTCTTCTTCCCTCATCTTACGCTCTCCCGCCGCTCTCTCCCGGTCTTCCTTCTCAGGCAGTTTCACCGGTTCTCACCGCCTCCGGCGCGGTGGTTACGTTCGTCTCTCTCTCCTGTCACCTCTCTGCCCAGAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015613
ATGTCTCCGCCGCCGCCGCCTAATTCTCCGCTAGACACCGTCGCTGCCAGATTTTCTGAATTTTTTTATTATATTTTTTGTATTTTTTTCTACATCTCCAGATTTCTGCAACTAGCTCATCTTAATATTCCCACCGACTCCTCACTTCGCTCCGCCTTCGTCGCCGACTTCCGTGCCGCCCGCTTTTGTGACCCCGCCTGTATTTCCTTCTCCCACTACCTTCTCAATTACAAGGGTTTCCTCGGTTGCCAGATTACATC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057800037.1
MSPPPPPNSPLDTVAARFSEFFYYIFCIFFYISRFLQLAHLNIPTDSSLRSAFVADFRAARFCDPACISFSHYLLNYKGFLGCQITSLRQTQVMGVMKQEQPERYLRLEHLLVRTYFDPNEVYQDSTKEKRRAQIAQAVAAEVSVVPPSRLMALIGQALKWQHHQGCGTQLFLCT

XP_057800038.1
MSPPPPPNSPLDTVAARFSEFFYYIFCIFFYISRFLQLAHLNIPTDSSLRSAFVADFRAARFCDPACISFSHYLLNYKGFLGCQITSLRQTQVMGVMKQEQPERYLRLEHLLVRTYFDPNEVYQDSTKEKRRAQIAQAVAAEVSVVPPSRLMALIGQALKWQHHQGF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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