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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001685`

染色体: Chr03 坐标: 22230667-22232603 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001685`
名称	SmilChr03G001685
描述	zinc finger protein CONSTANS-LIKE 2-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	22230667 - 22232603 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015620`
GeneID	`131015620`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015620`
原始查询	`LOC131015620`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger protein CONSTANS-LIKE 2-like
产物	zinc finger protein CONSTANS-LIKE 2-like
Arabidopsis	`AT5G41380` (AT5G41380) CCT motif family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834140] identity=50.8; qcov=0.85; evalue=1.36e-58; confidence=high
Rice	`Os01g0835700` (OsCCT01) - identity=61.6; qcov=0.354; evalue=6.28e-31; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0009909 (regulation of flower development)
KEGG	-
Pfam	PF06203 (CCT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015620

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800042.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057800042.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800042.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800042.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800042.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:22230996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:22231124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:22231970`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C60
`Chr3:22231970`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C60
`Chr3:22231993`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	39	A11,A21,A25,B10,B103,B120,B134,B137,B17,B21,B22,B24,B26,B29,B42,B48,B56,B69,B74,B76,B78,B79,B85,B90,B91,B92,B94,C12,C2,C39,C52,C57,C58,C61,C71,C73,C80,C86,D3
`Chr3:22232056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,C54,C82
`Chr3:22232095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800042.1

304 aa

152

304

CCT

PF06203 CCT 188-230 aa

XP_057800043.1

284 aa

142

284

CCT

PF06203 CCT 188-230 aa

XP_057800044.1

280 aa

140

280

CCT

PF06203 CCT 188-230 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800042.1`	Pfam	`PF06203`	CCT	Motif	188	230	4.2e-19	69.0	CCT motif
`XP_057800043.1`	Pfam	`PF06203`	CCT	Motif	188	230	3.6e-19	69.2	CCT motif
`XP_057800044.1`	Pfam	`PF06203`	CCT	Motif	188	230	3.5e-19	69.3	CCT motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944059.1
TCAAGTCGTTCCCTCGTCGAAGCTCTTCCCTCCCACACCCCAAATTGCACTTCTCTTTCTACAACTAGTGCGTGTGAGAGAAAACTAGTGGAAAATGGGATTCTTGTCATCTTGCTCCAGCTACGGACAAGAGGTTTGATTAAAGAAAAGACCCATCTGTCCTCACCCCGTGCCCACATTTTTTTCGAATTTCATTGCTCCATGTCTTCGGATATGTATGTGTTCGACAACTCCTTCTACTCCGATCAATTCTCGCCGTT...

XM_057944060.1
TCAAGTCGTTCCCTCGTCGAAGCTCTTCCCTCCCACACCCCAAATTGCACTTCTCTTTCTACAACTAGTGCGTGTGAGAGAAAACTAGTGGAAAATGGGATTCTTGTCATCTTGCTCCAGCTACGGACAAGAGGTTTGATTAAAGAAAAGACCCATCTGTCCTCACCCCGTGCCCACATTTTTTTCGAATTTCATTGCTCCATGTCTTCGGATATGTATGTGTTCGACAACTCCTTCTACTCCGATCAATTCTCGCCGTT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131015620
ATGTCTTCGGATATGTATGTGTTCGACAACTCCTTCTACTCCGATCAATTCTCGCCGTTCCTCGACTCCGCCGCCATCGACGCCTTCGGAATCTTCCAGGAAAACGATGAGAGCGCCGCCAGTCTGCACCAATTGGCGTCGGCTCTGCTGTCGTCGTCGCCGCCCAGCGCCGAGCTCCAGAATCTGTCGCTGTCGCACCTCGCGCCGGAGGTGAAGACGGAGGAATGCCAGCTCGGATTCAACAACAACTCCTTCTCACC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057800042.1
MSSDMYVFDNSFYSDQFSPFLDSAAIDAFGIFQENDESAASLHQLASALLSSSPPSAELQNLSLSHLAPEVKTEECQLGFNNNSFSPHETALKLMHRSYSSSSFDNSRADFSFRPHFDSVLEHTQILSSPETAFQSGQIRRVCSTGDLQKMKTSMQTRSVLSSSPLSAEKSFMEEANFKVGRYSAEERKERIDRYRAKRTQRNFNKTIKYACRKTLADTRPRIRGRFARNDEAGEIPKASMFQRYEDDDELWVIIFSPQK...

XP_057800043.1
MSSDMYVFDNSFYSDQFSPFLDSAAIDAFGIFQENDESAASLHQLASALLSSSPPSAELQNLSLSHLAPEVKTEECQLGFNNNSFSPHETALKLMHRSYSSSSFDNSRADFSFRPHFDSVLEHTQILSSPETAFQSGQIRRVCSTGDLQKMKTSMQTRSVLSSSPLSAEKSFMEEANFKVGRYSAEERKERIDRYRAKRTQRNFNKTIKYACRKTLADTRPRIRGRFARNDEAGEIPKASMFQRYEDDDELWTNLQMEGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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