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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001718`

染色体: Chr03 坐标: 23048437-23049338 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001718`
名称	SmilChr03G001718
描述	brassinosteroid-responsive RING protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	23048437 - 23049338 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015632`
GeneID	`131015632`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015632`
原始查询	`LOC131015632`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	brassinosteroid-responsive RING protein 1-like
产物	brassinosteroid-responsive RING protein 1-like
Arabidopsis	`AT3G61460` (BRH1) brassinosteroid-responsive RING-H2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825319] identity=60.6; qcov=0.976; evalue=4.27e-69; confidence=high
Rice	`Os04g0579200` - identity=49.6; qcov=0.692; evalue=3.12e-31; confidence=medium
GO	GO:0016567 (protein ubiquitination); GO:0061630 (ubiquitin protein ligase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF13445 (zf-RING_UBOX); PF13639 (zf-RING_2); PF13923 (zf-C3HC4_2); PF14634 (zf-RING_5); PF17123 (zf-RING_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015632

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057800058.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057800058.1`
3	Endosome	内体	0.40000	`XP_057800058.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057800058.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800058.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:23048972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,C27
`Chr3:23049066`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800058.1

169 aa

169

zf-RING_2

zf-RING_11

zf-RING_UBOX

zf-C3HC4

zf-C3HC4_2

zf-RING_5

PF13639 zf-RING_2 89-133 aa PF17123 zf-RING_11 90-118 aa PF13445 zf-RING_UBOX 90-130 aa PF00097 zf-C3HC4 90-132 aa PF13923 zf-C3HC4_2 90-132 aa PF14634 zf-RING_5 90-134 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800058.1`	Pfam	`PF13639`	zf-RING_2	Domain	89	133	1.6e-13	51.4	Ring finger domain
`XP_057800058.1`	Pfam	`PF17123`	zf-RING_11	Domain	90	118	2.2e-08	34.3	RING-like zinc finger
`XP_057800058.1`	Pfam	`PF13445`	zf-RING_UBOX	Domain	90	130	1.9e-06	28.5	RING-type zinc-finger
`XP_057800058.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	90	132	5.2e-08	33.3	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057800058.1`	Pfam	`PF13923`	zf-C3HC4_2	Domain	90	132	3.3e-07	30.7	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057800058.1`	Pfam	`PF14634`	zf-RING_5	Domain	90	134	1.5e-07	32.0	zinc-RING finger domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944075.1
ATGCCCATTTTCGTCATTTCACCTCACCCCCAACTTCCCCTATATAATCACCCCCACTTCTCCTTCTCCTCTCTCCCGTGCCTTCTCTCTCTCTCTCACACACAACTCAAACCTCCATTTTCATTCACACATTACACGCACTAACAGTAACGCAAAACACCTCCAATTCCGCTCAATTCGCGCTTCAGAATGGGGTTTCCGGTTGGATACACTGATTTATTCCTCCCGAAATTGCTGGTATATTTGCTAACGGTGTTAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015632
ATGGGGTTTCCGGTTGGATACACTGATTTATTCCTCCCGAAATTGCTGGTATATTTGCTAACGGTGTTAGGATTTGTGCGGAAATTCGTGTACGCTCTTCTATCTCTATTAGGGCTGGGGGATTTCCTGGAGCCGGAAACAGCGTCGTACGCGTCGCGCGAGGAGTCCGGGGCTGAGCCGAGGTCGGTGTCGGCGGCGCTGATTCGGGAGCTGCTGCCGGTGGTGAGGTTCGCGGATTTGGAGGAGGATCTAGACCCGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800058.1
MGFPVGYTDLFLPKLLVYLLTVLGFVRKFVYALLSLLGLGDFLEPETASYASREESGAEPRSVSAALIRELLPVVRFADLEEDLDPPESCAVCLYEFGGEDEIRRLTNCRHIFHRSCVDRWMDHDQKTCPLCRTQFIPEDMQEAFNERLWLASGISDLYGDYSPITAGL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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