当前解析结果
SmilChr03G001752| 统一新 Gene ID | SmilChr03G001752 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G001752 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G001752 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 23748316 - 23750116 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131015671 |
|---|---|
| GeneID | 131015671 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131015671 |
| 原始查询 | LOC131015671 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131015671 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057800073.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057800073.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057800073.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057800073.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057800073.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:23748408 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr3:23748440 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 41 | A10,A22,A3,A6,A7,B101,B104,B105,B108,B109,B115,B117,B133,B135,B19,B20,B22,B23,B36,B40,B48,B53,B58,B65,B66,B8,B80,B83,B93,B97,C1,C31,C34,C42,C59,C6,C63,C67,D10,D5,D6 |
Chr3:23748646 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A13,C13,C25,C5 |
Chr3:23748728 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B75 |
Chr3:23748794 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C29 |
Chr3:23748828 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B49 |
Chr3:23748876 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B13,B53 |
Chr3:23749127 |
TTA |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 95 | A16,A18,A19,A5,B10,B100,B103,B104,B107,B109,B11,B112,B118,B120,B125,B127,B128,B13,B131,B132,B134,B135,B137,B14,B140,B15,B16,B19,B2,B22,B27,B29,B3,B35,B37,B4,B44,B48,B5,B50,B54,B56,B58,B6,B60,B62,B65,B69,B7,B70,B71,B73,B74,B76,B78,B79,B81,B82,B94,B96,B97,C11,C15,C18,C2,C23,C24,C26,C29,C31,C33,C34,C35,C38,C40,C43,C44,C49,C50,C52,C55,C57,C61,C63,C69,C71,C73,C75,C77,C78,C79,C8,D1,D11,D9 |
Chr3:23749171 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A16 |
Chr3:23749198 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B85 |
Chr3:23749198 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B85 |
Chr3:23750021 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B1,B33,C82 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。