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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001780`

染色体: Chr03 坐标: 24309724-24311282 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001780`
名称	SmilChr03G001780
描述	dynamin-related protein 4C-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	24309724 - 24311282 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015687`
GeneID	`131015687`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015687`
原始查询	`LOC131015687`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dynamin-related protein 4C-like
产物	dynamin-related protein 4C-like
Arabidopsis	`AT1G60500` (DRP4C) Dynamin related protein 4C [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842345] identity=53.6; qcov=0.956; evalue=4.25e-134; confidence=high
Rice	`Os04g0129900` - identity=55.3; qcov=0.926; evalue=5.46e-135; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005874 (microtubule); GO:0008017 (microtubule binding); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00350 (Dynamin_N); PF01031 (Dynamin_M)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015687

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057800088.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057800088.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057800088.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800088.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800088.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:24310128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:24310153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr3:24310156`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr3:24310156`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr3:24310189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr3:24310192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:24310380`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B83,C5
`Chr3:24310509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,B24
`Chr3:24310521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,B24
`Chr3:24310539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr3:24310607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr3:24310618`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800088.1

406 aa

203

406

Dynamin_N

Dynamin_M

PF00350 Dynamin_N 79-193 aa PF01031 Dynamin_M 201-354 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800088.1`	Pfam	`PF00350`	Dynamin_N	Domain	79	193	4.9e-21	76.2	Dynamin family
`XP_057800088.1`	Pfam	`PF01031`	Dynamin_M	Family	201	354	2.5e-29	103.1	Dynamin central region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944105.1
TGGAGATGGTCTAAGATGAATCTCCTCAAAATATCCAAACACCATCGCCAACAAGCTGAAGAAGAGGACCAAGAATCATCTCCGGCGATGGCTCATGACGCCCCCATCGTTTCCCCCTACAACGCCCGAATCCGGCTGCTGCTGGACACCGTAGACAAGCTGCGCCACCTCAAGATCATGCAGGAAGACATCCAGCTGCCCACCATCGTTGTCGTCGGCGACCAGTCCTCCTTGACTCTCGTCATCAAGAAGAAAGCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015687
ATGAATCTCCTCAAAATATCCAAACACCATCGCCAACAAGCTGAAGAAGAGGACCAAGAATCATCTCCGGCGATGGCTCATGACGCCCCCATCGTTTCCCCCTACAACGCCCGAATCCGGCTGCTGCTGGACACCGTAGACAAGCTGCGCCACCTCAAGATCATGCAGGAAGACATCCAGCTGCCCACCATCGTTGTCGTCGGCGACCAGTCCTCCTTGACTCTCGTCATCAAGAAGAAAGCCAACGTCGTCGACGAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800088.1
MNLLKISKHHRQQAEEEDQESSPAMAHDAPIVSPYNARIRLLLDTVDKLRHLKIMQEDIQLPTIVVVGDQSSLTLVIKKKANVVDEIMYTTQEIAGKGKGISNTPLTLVVKKKGVPDLTMIDLPGITRVPVKGQLEDISEQISNIIMKYITPKESIILNVLSAGVDFPTCESIRMSQKVDKTGQRTLAVVTKADKSPEGLLEKIVADDVNIGLGNVCVRNRIDDESYEEARDEEANLFDNNPLLLRIDKSIVGIPALAER...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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