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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001798`

染色体: Chr03 坐标: 24598375-24600780 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001798`
名称	SmilChr03G001798
描述	dynamin-related protein 4C-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	24598375 - 24600780 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015698`
GeneID	`131015698`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015698`
原始查询	`LOC131015698`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dynamin-related protein 4C-like
产物	dynamin-related protein 4C-like
Arabidopsis	`AT1G60500` (DRP4C) Dynamin related protein 4C [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842345] identity=59; qcov=0.932; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0260000` - identity=55.4; qcov=0.927; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005874 (microtubule); GO:0008017 (microtubule binding); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00350 (Dynamin_N); PF01031 (Dynamin_M); PF02212 (GED)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015698

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057800094.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057800094.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800094.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800094.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800094.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:24598619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B47,B57,B78,C60,C72
`Chr3:24598826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,C62
`Chr3:24598895`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr3:24598904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,C33
`Chr3:24599021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B83
`Chr3:24599079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B129,B2
`Chr3:24599086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B75
`Chr3:24599086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:24599124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	34	A10,A19,B107,B111,B118,B120,B132,B28,B29,B44,B48,B58,B6,B60,B74,B79,B91,B96,C2,C23,C24,C26,C32,C33,C38,C40,C43,C44,C46,C52,C68,C71,C79,D9
`Chr3:24599147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B71
`Chr3:24599168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr3:24599207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800094.1

689 aa

344

689

Dynamin_N

Dynamin_M

GED

PF00350 Dynamin_N 84-258 aa PF01031 Dynamin_M 266-550 aa PF02212 GED 594-678 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800094.1`	Pfam	`PF00350`	Dynamin_N	Domain	84	258	2.5e-41	142.2	Dynamin family
`XP_057800094.1`	Pfam	`PF01031`	Dynamin_M	Family	266	550	6.1e-64	216.7	Dynamin central region
`XP_057800094.1`	Pfam	`PF02212`	GED	Family	594	678	2.6e-10	41.0	Dynamin GTPase effector domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944111.1
AGATTAATTATTGACCGAGACGTCCTTCTTCTACTCTGATTGGTGGCGGAAAAAAGCAGAATTGCCAAAGAGAAGAGAAAACCACTCTCATTAAGGAATTTATGGGCCCCCTACCCCTAAAGTAAAAGTAAAGGTGATATCCAGGAAATCACCTCCTTCGTAACAGACCTCATAAAATGCAGTAGCAAACTTCTCCATCCCACTACACAACACAAGCAATGCCTTTTGCTGCTAGAGAAGAAATGTCATCATCTACAGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015698
ATGCCTTTTGCTGCTAGAGAAGAAATGTCATCATCTACAGTGGTAGAGTCCGTGCCTAAGCTGAATCTCCTCAAAATATCCAAACACCATCGCCAACAAGCTGAAGAAGACGACCAAGAATCATCTCCGGCGACGGCTCATGACGCCCCCATCGTTTCCCCCTACAACGCCCGGATCCGGCCGCTGCTGGACACCGTAGACAAGCTGCGCCACCTCAAGATCATGCAGGAAGGCATCCAGCTCCCCACCATCGTCGTCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800094.1
MPFAAREEMSSSTVVESVPKLNLLKISKHHRQQAEEDDQESSPATAHDAPIVSPYNARIRPLLDTVDKLRHLKIMQEGIQLPTIVVVGDQSSGKSSVLESLAGIRLPRGDGICTRVPLIMRLKNHPSPEPQLSLEFNGKTVQTDEANVVDEIMYTTQEIAGKGKGISNTPLTLVVKKKGVPDLTMIDLPGITRVPVKGQPEDISEQISNIIMKYITPEESIILNVLSAGVDFPTCESIRMSQKVDKTGERTLAVVTKADK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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