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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000449`

染色体: Chr01 坐标: 9170480-9171238 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000449`
名称	SmilChr01G000449
描述	uncharacterized SmilChr01G000449
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	9170480 - 9171238 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015700`
GeneID	`131015700`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015700`
原始查询	`LOC131015700`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=47.6; qcov=0.288; evalue=6.19e-12; confidence=weak
Rice	`Os06g0597250` - identity=44.5; qcov=1.13; evalue=1.33e-68; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015700

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800128.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800128.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800128.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800128.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057800128.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:9170486`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B139
`Chr1:9170498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,B66
`Chr1:9170505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C49,C61
`Chr1:9170507`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B29,B66,C28,C39
`Chr1:9170512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B127,B132,B25
`Chr1:9170520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr1:9170537`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	27	A21,A3,A9,B10,B123,B127,B31,B42,B48,B53,B60,B64,B66,B7,B79,C17,C27,C31,C36,C39,C45,C47,C70,C76,C85,D1,D9
`Chr1:9170557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B53,C49
`Chr1:9170569`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B10,B37,B66
`Chr1:9170569`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B10,B37,B66
`Chr1:9170582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B3,B7
`Chr1:9170582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,B7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800128.1

219 aa

110

219

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 6-152 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800128.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	6	152	1.5e-67	227.9	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944145.1
ATGCACGAAGCCCGCCATGGGTTCCCGGGAATGTTGGGGAGCCTAGACTGCATGCATTGGGGATGGAAGAATTGCCCCGTGGCTTGGCATGGCGCCTACACTCGAGGGGATCAAGGCGAGCCAACAATTATATTAGAGGTCGTTGCTTCACAAGATTTGTGGATCTGGCATGCATTCTTTGGAGTCGCTGGGTTCAACAACGACATCAACGTGCTCCACCAGTCCACGCTATTCAACGATGTTTTAGCGGGGCATGAAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015700
ATGCACGAAGCCCGCCATGGGTTCCCGGGAATGTTGGGGAGCCTAGACTGCATGCATTGGGGATGGAAGAATTGCCCCGTGGCTTGGCATGGCGCCTACACTCGAGGGGATCAAGGCGAGCCAACAATTATATTAGAGGTCGTTGCTTCACAAGATTTGTGGATCTGGCATGCATTCTTTGGAGTCGCTGGGTTCAACAACGACATCAACGTGCTCCACCAGTCCACGCTATTCAACGATGTTTTAGCGGGGCATGAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800128.1
MHEARHGFPGMLGSLDCMHWGWKNCPVAWHGAYTRGDQGEPTIILEVVASQDLWIWHAFFGVAGFNNDINVLHQSTLFNDVLAGHEVAVHFLAKNSHHTRGYYLTDGIYPDWPVFVKSFQFLNDEKKRRFKEMQEAARKDVERAFGVLQARWGGNASHFDGDDDKGPSSTPQTQFNSGAPPEFAAYLARNASLKDARLHARLRDDLVEHIWARFGPVDP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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