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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001827`

染色体: Chr03 坐标: 25020396-25023163 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001827`
名称	SmilChr03G001827
描述	probable phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	25020396 - 25023163 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015718`
GeneID	`131015718`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015718`
原始查询	`LOC131015718`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase
产物	probable phospholipid hydroperoxide glutathione peroxidase
Arabidopsis	`AT4G11600` (GPX6) glutathione peroxidase 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826765] identity=77.4; qcov=0.97; evalue=1.1e-98; confidence=high
Rice	`Os04g0556300` (OsGpx1) - identity=82.8; qcov=0.929; evalue=3.02e-99; confidence=high
GO	GO:0004602 (glutathione peroxidase activity); GO:0005829 (cytosol); GO:0006979 (response to oxidative stress)
KEGG	smil00480 (Glutathione metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00255 (GSHPx); PF00578 (AhpC-TSA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015718

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057800122.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057800122.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057800122.1`
4	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	0.20000	`XP_057800122.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800122.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:25022136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B49,B87
`Chr3:25022163`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B47,B57,B78,C33,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800122.1

169 aa

169

AhpC-TSA

GSHPx

PF00578 AhpC-TSA 11-74 aa PF00255 GSHPx 11-119 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800122.1`	Pfam	`PF00578`	AhpC-TSA	Domain	11	74	1.1e-08	35.8	AhpC/TSA family
`XP_057800122.1`	Pfam	`PF00255`	GSHPx	Family	11	119	8.6e-43	145.0	Glutathione peroxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944139.1
ATATACAAATTATCTATGCCAATAGACCCTATCAAACGGCCCCTAAGTGAAGATCAAGTAAGGAAAGCAGCAGCAGATGATGAGATCATGCGAGAGATGGTTACTCTAATCGATGAGGAGGAGTTTGAAGCAACTCAAAGTTCCTCAAGAAGCGTGGAAGGCATTTCAAGGAATTTAGTGGCAGATGATGAAATCCTGCGAGAGATTGTTGCTCTACTTGATTAAGAAGAGGTTAGAGCAGCTCAAATTTCTTCGAGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015718
ATGGCCAGCCAATCAAACCAGCCTAATTCAATCCATGAGTTCACTGTTAAGGATGCTAAGGGCGATGATATCAATCTGAATACATACAAGGGCAAGGTCCTGCTGATTGTCAATGTTGCATCACAATGTGGACTGGCCAATTCTAATTACACTGAGCTGACACAGTTATATCAGAAATACAAGGATCAAGGATTGGAGATACTGGCATTTCCATGCAATCAGTTTGGTTCACAAGAGCCCGGTACTAACGAAGAAATTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800122.1
MASQSNQPNSIHEFTVKDAKGDDINLNTYKGKVLLIVNVASQCGLANSNYTELTQLYQKYKDQGLEILAFPCNQFGSQEPGTNEEIQEFVCTRFKAEYPVFDKVEVNGSNTAPIYKYLKSAKGGMFGDGIKWNFSKFLVDKDGHVVDRYAPTTSPLSIEKDIKKLIEKA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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