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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000061`

染色体: Chr03 坐标: 675286-684107 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000061`
名称	SmilChr03G000061
描述	uncharacterized SmilChr03G000061
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	675286 - 684107 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015728`
GeneID	`131015728`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015728`
原始查询	`LOC131015728`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transmembrane protein, putative (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819935]; symbol=AT3G07470; hit=AT3G07470; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	transmembrane protein, putative (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819935]; symbol=AT3G07470; hit=AT3G07470; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G07470` (AT3G07470) transmembrane protein, putative (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819935] identity=59.1; qcov=0.752; evalue=1.35e-34; confidence=medium
Rice	`Os01g0913100` - identity=60; qcov=0.641; evalue=2.78e-30; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04398 (DUF538)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015728

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057800131.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800131.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800131.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800131.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800131.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:675728`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	29	A13,A25,B114,B118,B119,B137,B22,B26,B3,B39,B45,B52,B61,B66,B7,B73,C24,C37,C46,C47,C5,C50,C53,C64,C76,D3,D5,D7,D9
`Chr3:675731`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B128,B15,B35,C25,C52,C59,D11
`Chr3:675732`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	29	A13,A25,B118,B119,B137,B22,B26,B3,B39,B44,B45,B61,B66,B7,B73,C24,C37,C46,C47,C5,C50,C53,C64,C76,C79,D3,D5,D7,D9
`Chr3:683798`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B130,B43,B63,C29,C5
`Chr3:683798`	`CCA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B130,B43,B63,C29,C5
`Chr3:683866`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:683868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr3:683906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C65
`Chr3:683923`	`TCG`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B1,B20,B47,B62
`Chr3:683950`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A7,B53,B70
`Chr3:683950`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B53,B70
`Chr3:683959`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B47,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800131.1

117 aa

117

DUF538

PF04398 DUF538 15-86 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800131.1`	Pfam	`PF04398`	DUF538	Family	15	86	1.1e-16	62.0	Protein of unknown function, DUF538

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944148.1
ATGGGGTATTACATCTTCCAGCTCCGCATGCTCTCCGCCTCGCCCAGCGACGCCAAATTCGAGACGCCGTTGAGATACCAGTGCAACATTACGGGCAGGCTCAGCTACGGCCAGGTTTCCGATCTGTCCGGCGTTGCTGCCCAGGATCTCTTCCTGTGGCTGCCCGTGAAGAGCATTCGTGTCGATATTCCCAGCTCCGGCCTCATTTACTTCGACGTTGGTATGGTGTTCAAGCAGTTCTCTCTGTCCTTCTTCAAGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015728
ATGGGGTATTACATCTTCCAGCTCCGCATGCTCTCCGCCTCGCCCAGCGACGCCAAATTCGAGACGCCGTTGAGATACCAGTGCAACATTACGGGCAGGCTCAGCTACGGCCAGGTTTCCGATCTGTCCGGCGTTGCTGCCCAGGATCTCTTCCTGTGGCTGCCCGTGAAGAGCATTCGTGTCGATATTCCCAGCTCCGGCCTCATTTACTTCGACGTTGGTATGGTGTTCAAGCAGTTCTCTCTGTCCTTCTTCAAGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800131.1
MGYYIFQLRMLSASPSDAKFETPLRYQCNITGRLSYGQVSDLSGVAAQDLFLWLPVKSIRVDIPSSGLIYFDVGMVFKQFSLSFFKTPKECNALSGDFAVLTMAVLQLVLLRIHGAS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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