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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000077`

染色体: Chr03 坐标: 935441-943382 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000077`
名称	SmilChr03G000077
描述	disease resistance protein RPH8A-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	935441 - 943382 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015731`
GeneID	`131015731`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015731`
原始查询	`LOC131015731`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	disease resistance protein RPH8A-like
产物	disease resistance protein RPH8A-like
Arabidopsis	`AT1G58390` (AT1G58390) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842208] identity=32.1; qcov=0.978; evalue=1.06e-62; confidence=low
Rice	`Os10g0358200` - identity=28.6; qcov=1; evalue=1.03e-40; confidence=low
GO	GO:0006952 (defense response); GO:0043531 (ADP binding)
KEGG	-
Pfam	PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015731

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057800133.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057800133.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057800133.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057800133.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800133.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:935454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C53
`Chr3:935475`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr3:935479`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,B72
`Chr3:941709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B41,B71,C10,C74,D1
`Chr3:941728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B23,C11,C48,C51,C69
`Chr3:941803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr3:941817`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	C8,D10,D6
`Chr3:941817`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	C8,D10,D6
`Chr3:941834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,B86
`Chr3:941876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr3:941944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr3:941950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B111,B121,B22,B97,C11,C51,C69,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800133.1

601 aa

300

601

WHD_DRP

LRR_14

PF23559 WHD_DRP 112-186 aa PF23598 LRR_14 261-572 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800133.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	112	186	4.1e-09	37.1	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057800133.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	261	572	1.3e-23	84.1	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944150.1
ATGGAGAGAGGCGGCGATGCGGCTGGTGGTCGTGCCGACGCCGGGGAAGGGGGCGGCGCAGAATTTGCTTTGGAAGAAAAATTACTAGAGAAAATCGGGAAAGAATTGGCAGGGAAATGTGGTAATTTGGCTCTAGCAATTTGTATACTCGGTGGGGTGTTGAGAAATAAAAAATCTGTGAAGGATTGGGAGTCGGTAAATGAGAACTTCAAGGCAGTTCTATATGGAGCCCACGATGCAATGGACAGGAAAATTGAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015731
ATGGAGAGAGGCGGCGATGCGGCTGGTGGTCGTGCCGACGCCGGGGAAGGGGGCGGCGCAGAATTTGCTTTGGAAGAAAAATTACTAGAGAAAATCGGGAAAGAATTGGCAGGGAAATGTGGTAATTTGGCTCTAGCAATTTGTATACTCGGTGGGGTGTTGAGAAATAAAAAATCTGTGAAGGATTGGGAGTCGGTAAATGAGAACTTCAAGGCAGTTCTATATGGAGCCCACGATGCAATGGACAGGAAAATTGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800133.1
MERGGDAAGGRADAGEGGGAEFALEEKLLEKIGKELAGKCGNLALAICILGGVLRNKKSVKDWESVNENFKAVLYGAHDAMDRKIEEVVTLSYENLPYNLKPCFLSLGILREDEIIGVEELYGMWIAQGIIPNQGNDGSLMDTAELFLHELAMASIVQLVDDEIEYRPPPIGKFSTCKLHDIVRELCLKIGEKEDFGVAILEYNDGILRTITRGARQRHLAIHFRNKYEDRLPTETHPHEDVRSLRILNDAIDFQAIEFP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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