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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G001664`

染色体: Chr03 坐标: 21584339-21587644 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G001664`
名称	SmilChr03G001664
描述	mitogen-activated protein kinase 4-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	21584339 - 21587644 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015736`
GeneID	`131015736`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015736`
原始查询	`LOC131015736`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitogen-activated protein kinase 4-like
产物	mitogen-activated protein kinase 4-like
Arabidopsis	`AT4G01370` (MPK4) MAP kinase 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828151] identity=81.7; qcov=0.962; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0157000` (OsMAPK2) - identity=77.8; qcov=0.978; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004707 (MAP kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0035556 (intracellular signal transduction)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015736

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800140.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057800140.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800140.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800140.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800140.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:21584677`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,D1
`Chr3:21584896`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr3:21586938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B73
`Chr3:21586938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr3:21586939`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,C13,C25,C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800140.1

369 aa

184

369

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 40-233 aa PF00069 Pkinase 40-322 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800140.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	40	233	4.8e-33	115.3	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057800140.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	40	322	1.5e-68	231.8	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944157.1
TTTTTATTTTTTTTTCATAAAAAGCATAAATAAATAAGTTGTCTACTTGAGTCCCATTTCAAACTGTATTTCCACTTTCTCTTCAAAGTTCAAACTAAAATCTCAAACCCAGCAAATCTCAAGCACTATCATCTCCATTACTCAACCCCGCCGCCATCGCCGTCGCCGCCGCCTCCGCCGGAAAACTCTCCACTACTATTGTTCCTTATGGCTCCAGAAAGCAAGCCTAATATCAGCGGAGTGCTGACGCACGGCGGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015736
ATGGCTCCAGAAAGCAAGCCTAATATCAGCGGAGTGCTGACGCACGGCGGGAAGTACGTGCGCTACAATCTGTACGGTAACCTGTTTGAGGTATCCAGTAAATATATCCCGCCGCTTCGCCCCCTCGGCCGCGGCGCCTACGGCCTCGTCTGCTCGGCTGTGAATAAAGAGGCTAATGAGGAGGTTGCGATTAAAAAAATTGGGAACGCATTTGATAACAGAATTGATGCCAAGAGGACTTTAAGGGAGATTAAGCTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800140.1
MAPESKPNISGVLTHGGKYVRYNLYGNLFEVSSKYIPPLRPLGRGAYGLVCSAVNKEANEEVAIKKIGNAFDNRIDAKRTLREIKLLRHLDHENLIAIKDIIRPPKREAFNDVYIVYELMDTDLHQIIRSDQALTDDHCQYFLYQLLRGLRYVHSAHVLHRDLKPSNLFLNANCDLKIGDFGLARTTSETDFMTEYVVTRWYRAPELLLNCSDYTAAIDVWSVGCILAEIMTREPLFPGKDYVHQLRLITELLGTPDEAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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