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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000092`

染色体: Chr03 坐标: 1029068-1031725 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000092`
名称	SmilChr03G000092
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-14
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	1029068 - 1031725 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015738`
GeneID	`131015738`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015738`
原始查询	`LOC131015738`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-14
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-14
Arabidopsis	`AT1G50180` (AT1G50180) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841440] identity=30.6; qcov=0.844; evalue=7.71e-78; confidence=low
Rice	`Os09g0479500` - identity=31.4; qcov=0.817; evalue=8.3e-76; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015738

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057800142.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800142.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800142.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800142.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800142.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:1029226`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C55
`Chr3:1029226`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C55
`Chr3:1029286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr3:1029302`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr3:1029546`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C45
`Chr3:1029546`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C45
`Chr3:1029555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B75
`Chr3:1029573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B43,C43,C74
`Chr3:1029574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr3:1029576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B114,B70,C63,D11
`Chr3:1029623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C52,D10
`Chr3:1029730`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	22	A13,A19,A20,A4,B112,B119,B120,B13,B136,B18,B22,B63,B64,B83,C22,C24,C49,C54,C57,C59,C78,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800142.1

737 aa

368

737

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 159-322 aa PF23559 WHD_DRP 408-479 aa PF23598 LRR_14 536-715 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800142.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	159	322	1e-39	136.6	NB-ARC domain
`XP_057800142.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	408	479	7.4e-23	81.1	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057800142.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	536	715	1.8e-17	63.9	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944159.1
AATAATATGGTTGTTAGGATGTCATAATTGTATCTTTTCAATAATACATTGTTAGATAGAATTGAATCATTACCAGTTTCTCTCTGCAATTGTTATTGTTCCTTCATATGATCTGCAAAATCTTGTAGCAAGAGCATAATTTATTTCTTCTCTTCTCATTCTCTCTCTGCAGTTGTTCCAACTTTTTATCTTCGAAATCTTGTATTAAGAATATAGTTTTATCTCTTTATGGTTCCTTCATTTCATCTGCAAAATCTTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015738
ATGGCTTATTCTACACTTGTTTCCCTTGAGCGCACCATTGATCAATTCCTCAATCACAATCAATTTTCCATTTCTCCTCCTGAAAAAAAACATATTATATCTCTAGATAAATATGTCCTTTCACTCCAAGCTTTTCTTGAGGATTTTCCGGAGAAAACCAAGAGTTTGGAAGCAAGAATGAGTAATGTAGCAATGGAGGCGGAAGATGTTATTGAATTGTATATGACGGAAAAAATCCACTACAATATTCGATATACCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800142.1
MAYSTLVSLERTIDQFLNHNQFSISPPEKKHIISLDKYVLSLQAFLEDFPEKTKSLEARMSNVAMEAEDVIELYMTEKIHYNIRYTHWVAELRRIKFIFQLRRVRDQMDSIAGEVVQIKNSIIIKDAQLDGYVGASSSSSQGAEAGKTNMVGLNVDLMEIMSRLCGDSRELQILPITGMGGIGKTTLARNAYDHPFSMEHFQIRVWVTISQDYSEQRILSNLLDSLKEFDRERGNISMAVKVYQILVGRRFLIVMDDIWS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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