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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000104`

染色体: Chr03 坐标: 1155514-1158696 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000104`
名称	SmilChr03G000104
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	1155514 - 1158696 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015743`
GeneID	`131015743`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015743`
原始查询	`LOC131015743`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=29.1; qcov=0.76; evalue=2.87e-67; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=30.3; qcov=0.724; evalue=8.24e-82; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015743

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057800148.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057800148.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057800148.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800148.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800148.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:1155564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr3:1155573`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B26,B42,B5,C24
`Chr3:1155573`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B26,B42,B5,C24
`Chr3:1155577`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B26,B42,B5,C24,C80,D8
`Chr3:1155627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B103,B138,B41,B53,C24,C47
`Chr3:1155656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,C80,D8
`Chr3:1155658`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C74,D1
`Chr3:1155668`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B2,B24,B60,B62
`Chr3:1155671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,B60,C6
`Chr3:1155672`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B13,C58,D10
`Chr3:1155672`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B13,C58,D10
`Chr3:1155676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A13,A21,B108,B109,B22,B56,B78,B88,C16,C3,C62,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800148.1

980 aa

490

980

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 252-413 aa PF23559 WHD_DRP 500-571 aa PF23598 LRR_14 623-927 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800148.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	252	413	6.6e-41	140.5	NB-ARC domain
`XP_057800148.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	500	571	3.8e-18	66.0	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057800148.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	623	927	1.5e-18	67.4	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944165.1
AAAGGTGGATGAAAAGCTGCACACATAATGTTTCTGATAATAATTGAGAAGAGGAGATATACCCATTTTACACATTGTTTTTGCTCAACCTAAACTCAGATTCTATCAAATTCTTTCTCAGAAAAATAAACATACACTGTTTTTCCTTGGATCATGGCGGCATATGCAGCCTTGGTTTCTCTTATGCATATCATTGATACAATCGAGCATCACCATTCCCCTCCAATTTCTATCGACAAACAACAAGTTGAATCTCTCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015743
ATGGCGGCATATGCAGCCTTGGTTTCTCTTATGCATATCATTGATACAATCGAGCATCACCATTCCCCTCCAATTTCTATCGACAAACAACAAGTTGAATCTCTCACTCAAATTCTTACCTTTTTGCAGGAATTTCTTGAAAGTTATAAGTCCCCTGTTGCCGACGGAGATGAAGCTGATCCGCTGGAGATGCGTATCGCAGATGCAGCTCATGCTGTTGAAGATGTTATCGAATCACATATTGTGGACAAGCTTCAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800148.1
MAAYAALVSLMHIIDTIEHHHSPPISIDKQQVESLTQILTFLQEFLESYKSPVADGDEADPLEMRIADAAHAVEDVIESHIVDKLQPRRSKRIADAAYAAEDAIESHIVDKLQLRRSKKAKIDTAEADEQINFYQDRLQQVIEEMNVIKKEAMENELGRSMSPNEEFLQGYVVDAAHAAEEVNSREEVSCIDFYQDLQQVIEEMNVINKEAMETSAEAQLQRKVSSTHAGSLTSSSTVKESMMVGFDDVQLQLLDWLTGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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