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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000107`

染色体: Chr03 坐标: 1188256-1190415 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000107`
名称	SmilChr03G000107
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-14
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	1188256 - 1190415 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015744`
GeneID	`131015744`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015744`
原始查询	`LOC131015744`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-14
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-14
Arabidopsis	`AT1G59620` (CW9) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842252] identity=27.2; qcov=0.742; evalue=3.95e-45; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=28.1; qcov=0.97; evalue=2.18e-51; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015744

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057800149.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057800149.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800149.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800149.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800149.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:1188278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B5,B66,C18,D5
`Chr3:1188278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B5,B66,C18,D5
`Chr3:1188297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C46
`Chr3:1188306`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A2,B120,B41,B71,C10,C74,D1
`Chr3:1188322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr3:1188359`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr3:1188391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:1188399`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	20	B133,B23,B3,B34,B38,B39,B86,B87,B94,B95,C1,C11,C12,C13,C48,C65,C69,C80,C85,D6
`Chr3:1188407`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B3,B86,B95,B96,C12
`Chr3:1188407`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B3,B86,B95,B96,C12
`Chr3:1188435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr3:1188463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B84,C16,C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800149.1

663 aa

332

663

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 121-211 aa PF23559 WHD_DRP 334-404 aa PF23598 LRR_14 455-628 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800149.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	121	211	3.2e-18	66.6	NB-ARC domain
`XP_057800149.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	334	404	6.7e-17	62.0	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057800149.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	455	628	3.5e-11	43.2	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944166.1
ATGGCGGCATATGCAGCCTTGGAATTTCTTGATGGTTATAAGTCCCCTGTTGCTGACGGAGATGAAGCTGATCCGCTGGAGATGCGTATCGCAGATGCCACTTATGCGGCTGAAGATGCTATCGAATCTCATATTGTGGACATGATTCAACTGGGTAGATCTACTTCCAACGAAGTCAGTTTCTTCTATGAAGATCTACAACAAGTGATAGAAGAAATGAATGTAATTAAGAACGAAGCCATGGAGATTGCAGCCGAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015744
ATGGCGGCATATGCAGCCTTGGAATTTCTTGATGGTTATAAGTCCCCTGTTGCTGACGGAGATGAAGCTGATCCGCTGGAGATGCGTATCGCAGATGCCACTTATGCGGCTGAAGATGCTATCGAATCTCATATTGTGGACATGATTCAACTGGGTAGATCTACTTCCAACGAAGTCAGTTTCTTCTATGAAGATCTACAACAAGTGATAGAAGAAATGAATGTAATTAAGAACGAAGCCATGGAGATTGCAGCCGAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800149.1
MAAYAALEFLDGYKSPVADGDEADPLEMRIADATYAAEDAIESHIVDMIQLGRSTSNEVSFFYEDLQQVIEEMNVIKNEAMEIAAEAQLQRKVSLTHAGSLTSSSNVKERMMVGFDDVQLQLLDWLTGGNCKRQIIPIVGMGGIGKTTLARHIFEHALVKEHFDIRAWTIISQTYNVRETLSQVLHQVTGNLGSDLSEEDLGEKLYKYLLCRSSRNNLATELTNSNSIDMRFLDDVSSWSLFSKTVFGGEGFPLQLKEIG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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