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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000108`

染色体: Chr03 坐标: 1196988-1201006 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000108`
名称	SmilChr03G000108
描述	uncharacterized SmilChr03G000108
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	1196988 - 1201006 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015745`
GeneID	`131015745`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015745`
原始查询	`LOC131015745`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0152500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os01g0152500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0152500` - identity=27.2; qcov=0.39; evalue=4.3e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015745

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800150.1`
2	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057800150.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057800150.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800150.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800150.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:1198396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:1198403`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B74,C41,C43
`Chr3:1198412`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr3:1198435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr3:1198437`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	39	A10,A11,A20,A21,A7,B121,B126,B16,B17,B18,B28,B30,B38,B6,B62,B72,B77,B83,B97,C10,C18,C31,C34,C37,C39,C40,C46,C51,C52,C54,C56,C59,C69,C71,C78,C80,C85,C86,D3
`Chr3:1198438`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	39	A10,A11,A20,A21,A7,B121,B126,B16,B17,B18,B28,B30,B38,B6,B62,B72,B77,B83,B97,C10,C18,C31,C34,C37,C39,C40,C46,C51,C52,C54,C56,C59,C69,C71,C78,C80,C85,C86,D3
`Chr3:1198442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C62
`Chr3:1198469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,C27
`Chr3:1198470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C27,D10
`Chr3:1198492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr3:1198493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C36
`Chr3:1198511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800150.1

528 aa

264

528

DUF8566

PF29561 DUF8566 1-188 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800150.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	1	188	3.8e-48	164.7	Domain of unknown function (DUF8566)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944167.1
TGATTTATTATTGTTTAGGGACGCCCAAAAGCAAATCAAAAGGGAAAGGTGTGAATGATGCTAGTGATTTCGTTGAGGGTAGTCCTCGTGTTACAAGAGGTGAAATATTGAAGAGGAAATTGGGTGAGACGTCGGGCAAAGATGCTGCTGGTAGTTCGGTTGTTCCTGATGTTGGAGTTGTTTCTCCGGTAGCTCCTGCCAAGAGGAAAAGGATTGACAAGCGAAAGCTTGCAGTGGGAAACTACACTAAGTTACAAGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015745
ATGAACGACGTCCAGAAAGAGGCTGTTAAATCATTGGGGTTCGGGTCTGTCCTTGATCTTACAATCCAGGAGATGCCGTCAAAGCTAGATTATTGGGTGCTAGATTGCTTCCATGCCCGAAGGTCGGAGATCGTGCTTCCATCTGGGAAGACAATTGAGGTGACAGATGAGGATGCCTATCGCGTACTCGGATTTCCTCGTGGTGATAGATCGTTGGAACTTCTGGATAAGAGTGAGACTACAGACTTGTATGATGAGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800150.1
MNDVQKEAVKSLGFGSVLDLTIQEMPSKLDYWVLDCFHARRSEIVLPSGKTIEVTDEDAYRVLGFPRGDRSLELLDKSETTDLYDEWVSCFPDKNQKTIKISDVKDAMIASVDGGRWFKLHFLVMVTHCLIESTTHGSVIPRVIKSLDDLTAVRDFNWCEYVVDSLVESKGKWEKDTQSMYTGPIMFLAVFYVDRVTWARVRVSRSFPLFKNWCTKKLKDRELDEINCGRFGDGIILDPIEVEDESITAIIGKKLKMFER...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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