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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000231`

染色体: Chr03 坐标: 2745107-2747422 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000231`
名称	SmilChr03G000231
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	2745107 - 2747422 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015781`
GeneID	`131015781`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015781`
原始查询	`LOC131015781`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=29.5; qcov=0.896; evalue=6.03e-70; confidence=low
Rice	`Os10g0183000` (OsLSR) - identity=29.6; qcov=0.956; evalue=1.26e-72; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015781

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057800188.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057800188.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057800188.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800188.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800188.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:2745107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr3:2745119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B82,C83
`Chr3:2745125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B27
`Chr3:2745156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr3:2745181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,A8,C36,C42,C82
`Chr3:2745184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B97,C74
`Chr3:2745199`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B119
`Chr3:2745199`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr3:2745204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr3:2745205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr3:2745212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C78,D11
`Chr3:2745214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800188.1

771 aa

386

771

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 72-240 aa PF23559 WHD_DRP 316-386 aa PF23598 LRR_14 443-634 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800188.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	72	240	4.5e-43	147.5	NB-ARC domain
`XP_057800188.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	316	386	6.9e-19	68.4	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057800188.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	443	634	8.3e-23	81.4	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944205.1
ATGCTGACTACTGCTTCATCAACAAGATCTGCACTCAAGAGTGAAGATGATGATTTTCATGAAGATTTGACTGTAGCAACACAACTGGCTGTCAGCATTTCAAACCGGTTGGGGAGATTAGCGGAGAGAATTAAGTGGACTGCTGTTGGTTCATCATCAAGATCTTCACCGACAAGTAAGGATATCGTGGTTGGTTTTGATGAAGATAGGTTGCAGATATTGTCCTGGCTTAGAAGCTATTCATCCGAGCTGCAAGTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015781
ATGCTGACTACTGCTTCATCAACAAGATCTGCACTCAAGAGTGAAGATGATGATTTTCATGAAGATTTGACTGTAGCAACACAACTGGCTGTCAGCATTTCAAACCGGTTGGGGAGATTAGCGGAGAGAATTAAGTGGACTGCTGTTGGTTCATCATCAAGATCTTCACCGACAAGTAAGGATATCGTGGTTGGTTTTGATGAAGATAGGTTGCAGATATTGTCCTGGCTTAGAAGCTATTCATCCGAGCTGCAAGTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800188.1
MLTTASSTRSALKSEDDDFHEDLTVATQLAVSISNRLGRLAERIKWTAVGSSSRSSPTSKDIVVGFDEDRLQILSWLRSYSSELQVLPIVGMGGIGKSTLAKIVYDDTFMTYHFDFHAWVTISKDYSVESILSNLLASMKGKGIQAESDLQCEEKESEIYKYLKGRRYLIVMDDMWSTVAWDQVRRLLPDDNNGSRILLTTRLKNVATYTSSMSPIHTMRFLDDQQSWRLFQKKVFGDQDCPVELQDIGKKYVKRCEGLP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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