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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000234`

染色体: Chr03 坐标: 2794881-2797535 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000234`
名称	SmilChr03G000234
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	2794881 - 2797535 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015782`
GeneID	`131015782`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015782`
原始查询	`LOC131015782`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT1G58390` (AT1G58390) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842208] identity=27.1; qcov=0.804; evalue=8.74e-62; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=29.1; qcov=0.781; evalue=2.58e-73; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015782

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057800189.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057800189.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057800189.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800189.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800189.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:2794904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr3:2794908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr3:2794931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	36	A1,A5,B104,B107,B110,B114,B122,B125,B136,B20,B24,B25,B45,B52,B63,B65,B66,B69,B72,B73,B86,B97,C13,C18,C2,C33,C41,C43,C48,C49,C54,C6,C69,C72,C77,C9
`Chr3:2794940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,C11
`Chr3:2794952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,C21,C64,C71
`Chr3:2794997`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B85
`Chr3:2794998`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr3:2795000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B118,B20,C35,D7
`Chr3:2795024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,C64
`Chr3:2795025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B55
`Chr3:2795028`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B15,B31,B54,B86,C47
`Chr3:2795033`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800189.1

884 aa

442

884

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 163-332 aa PF23559 WHD_DRP 417-488 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800189.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	163	332	1.3e-40	139.5	NB-ARC domain
`XP_057800189.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	417	488	2.6e-14	53.7	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944206.1
ATGGCGGCCTACGCAGCCTTGGTTTCTCTAATGCATATCATAGACGACCTCGAGCACCACCATTCTCCTCCGATTTCTCTCAACAAACAACAAGTTCAATCCCTCACTGAAAATGTCATGTTCTTGCAGGAGTTTCTCGAAGCTTATAACTCCCCTGTTTCCGACGAAGCAGATCCCTTGGAGATGCGTATTGCAGATGCAGCTTATGCAGCTGAAGACGCCATCGAATCTCGTATCGTGGCCAAGATTCAGCTGAGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015782
ATGGCGGCCTACGCAGCCTTGGTTTCTCTAATGCATATCATAGACGACCTCGAGCACCACCATTCTCCTCCGATTTCTCTCAACAAACAACAAGTTCAATCCCTCACTGAAAATGTCATGTTCTTGCAGGAGTTTCTCGAAGCTTATAACTCCCCTGTTTCCGACGAAGCAGATCCCTTGGAGATGCGTATTGCAGATGCAGCTTATGCAGCTGAAGACGCCATCGAATCTCGTATCGTGGCCAAGATTCAGCTGAGCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800189.1
MAAYAALVSLMHIIDDLEHHHSPPISLNKQQVQSLTENVMFLQEFLEAYNSPVSDEADPLEMRIADAAYAAEDAIESRIVAKIQLSRSRETYNSVSSNHDDDDEEMNLFRDVQNVRQEMDQIKSLAMQRNTEKVVIHDKLRSFVSASSSTGKNSSGMVVWSEGVVNGILEMLVSDQHERQVIPITGMGGIGKTTLAKTVYSKKIIEQRFDVCAWATISQQYNTREILCELVSQATKKSKEQLSEKSEDELGFELYQHLMG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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