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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000238`

染色体: Chr03 坐标: 2828665-2838762 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000238`
名称	SmilChr03G000238
描述	uncharacterized SmilChr03G000238
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	2828665 - 2838762 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015784`
GeneID	`131015784`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015784`
原始查询	`LOC131015784`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0633500; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os11g0633500; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=37; qcov=0.226; evalue=5.95e-62; confidence=weak
Rice	`Os11g0633500` - identity=36.9; qcov=0.229; evalue=3.54e-66; confidence=weak
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015784

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057800191.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057800191.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057800191.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800191.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800191.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:2830025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr3:2830068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C24
`Chr3:2830073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr3:2830083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr3:2830158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B61,C10,D6
`Chr3:2830203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:2830268`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B92
`Chr3:2830268`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B92
`Chr3:2830298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B118,C53
`Chr3:2830306`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A6,B26,B32,B42,B5,C24,C49,D4
`Chr3:2830315`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr3:2830352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800191.1

1550 aa

775

1550

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 548-716 aa PF23559 WHD_DRP 792-862 aa PF23559 WHD_DRP 1117-1178 aa PF23598 LRR_14 1232-1423 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800191.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	548	716	4.3e-46	157.4	NB-ARC domain
`XP_057800191.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	792	862	4.3e-33	113.9	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057800191.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	1117	1178	4.3e-33	113.9	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057800191.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	1232	1423	4.9e-24	85.4	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944208.1
AACAAAAACTAAAGTGCTTGAGAGCATAAAGTAAGAAAAGACAAAGGCAAAATAATAAAAAATAAAATTGAAAACAAACCAACAATTTTTTTGACAAAATAGACAACTCCAAGAAAATCGGTTAAAAAAAAGCTATATAACCAACGGATTCAGATCCGTCAAGACCCAGGTGTCTGTCCGAAAGTTCCAAGCTGGCCACCCCCAACCAAACGGTGAGAGAGCCAAAATCAAAACCAGAGAGACTCCTTCTTCCGCGGGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015784
ATGGCTTCTGAAGCTATCGATTCCCTGCTACAAACTTTACGCCAAATCCTTAAACGCGACGATGTTCTCACCACTCTTCGTGTTAAACAACGAATTATATCCATCCACGATAAAGCTGTGTTCTTGCTGTTGAATCTCAAACATTTCCCAAAACAAGAAACTATCAGGGAGGTAGTAAATACAACACAAGAGATTATTGAGTATATTTTCTCCCCAGAAAATGTTTCAGATTGTGGGTCGACAGAGGCGAGTGTGAGACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800191.1
MASEAIDSLLQTLRQILKRDDVLTTLRVKQRIISIHDKAVFLLLNLKHFPKQETIREVVNTTQEIIEYIFSPENVSDCGSTEASVRLSIQLGELAGELPSTAADVVDYCNSHDDLVRNLRRRSDSSSRSAIVLIVSLLCLLLKVERIIWTARSLSIYYRFSDYFRFCNRSLKNHDRFFRFFIRLSDFDEDLRVATELIVSISIRLLGLAERIMSTTGDSVDNVGRQSDSPAVRSSSRSALNSEDFDDLHGDPTLATKLFV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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