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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G000266`

染色体: Chr03 坐标: 3077461-3079458 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G000266`
名称	SmilChr03G000266
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	3077461 - 3079458 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015800`
GeneID	`131015800`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015800`
原始查询	`LOC131015800`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
Arabidopsis	`AT1G59780` (AT1G59780) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842271] identity=26.9; qcov=1.03; evalue=3.06e-57; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=30.6; qcov=0.997; evalue=1.1e-76; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015800

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057800204.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057800204.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057800204.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800204.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800204.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:3077475`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,C62
`Chr3:3077535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B3,C52
`Chr3:3077547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B54,B88
`Chr3:3077577`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C45
`Chr3:3077577`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C45
`Chr3:3077617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B91,C45,C71
`Chr3:3077629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A4,B122,B124,B136,B17,B26,B29,B3,B46,B47,B64,C47,C55,C78,C8,D9
`Chr3:3077632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B11,B91,B94
`Chr3:3077690`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B122,B124,B17,B68
`Chr3:3077690`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B122,B124,B17,B68
`Chr3:3077697`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	19	B26,B28,B44,B85,B91,C13,C21,C27,C35,C4,C45,C56,C66,C7,C80,C81,C86,C87,D7
`Chr3:3077726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800204.1

665 aa

332

665

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 1-142 aa PF23559 WHD_DRP 228-298 aa PF23598 LRR_14 345-538 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800204.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	1	142	1.6e-31	109.9	NB-ARC domain
`XP_057800204.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	228	298	3.8e-17	62.8	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057800204.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	345	538	1.2e-20	74.4	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944221.1
ATGGGCGGGATTGGTAAGACCACTCTTGCCCGACATATATTTGAGCATGCCCTTGTTAAGGAGTATTTTCATATTCGTGTGTGGACTACGATTTCTCAAACTTATAATGTTAGAGAAACACTTAGGCAAGTTCTTCACCAAGAAAGTGGAAATTTGGGTAGTGATCTGAGTGAGGAAGATTTAGGAGAAAAATTGTACAAGTATTTATGCGGTAGGAGGTATATTATAATACTGGATGATATGTGGAGTATAGAGGTGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015800
ATGGGCGGGATTGGTAAGACCACTCTTGCCCGACATATATTTGAGCATGCCCTTGTTAAGGAGTATTTTCATATTCGTGTGTGGACTACGATTTCTCAAACTTATAATGTTAGAGAAACACTTAGGCAAGTTCTTCACCAAGAAAGTGGAAATTTGGGTAGTGATCTGAGTGAGGAAGATTTAGGAGAAAAATTGTACAAGTATTTATGCGGTAGGAGGTATATTATAATACTGGATGATATGTGGAGTATAGAGGTGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800204.1
MGGIGKTTLARHIFEHALVKEYFHIRVWTTISQTYNVRETLRQVLHQESGNLGSDLSEEDLGEKLYKYLCGRRYIIILDDMWSIEVWDKMRFFFPDYNDGSRVIVTTRLSNLAAELTNSNSIGMRFLDDVCSWSLFSKTVFGGEGFPLQLEEIGKKIVGKCKGLPLSIAVIGGLLAKSELTLEYWERIEKNLSSIVNSENDEYCLRVLKLSYDHLPAYLRPCFLYMGMYGEDQRIEVSELKRLWVSEGFLKPIINKSSKT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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