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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002724`

染色体: Chr03 坐标: 43260137-43262411 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002724`
名称	SmilChr03G002724
描述	pectin acetylesterase 11-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	43260137 - 43262411 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015892`
GeneID	`131015892`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015892`
原始查询	`LOC131015892`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectin acetylesterase 11-like
产物	pectin acetylesterase 11-like
Arabidopsis	`AT5G45280` (AT5G45280) Pectinacetylesterase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834564] identity=47.8; qcov=0.872; evalue=2.2e-92; confidence=high
Rice	`Os02g0702400` - identity=46.9; qcov=0.917; evalue=1.29e-92; confidence=high
GO	GO:0009505 (plant-type cell wall); GO:0052793 (pectin acetylesterase activity); GO:0071555 (cell wall organization)
KEGG	-
Pfam	PF03283 (PAE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015892

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057800365.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057800364.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800364.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800364.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800364.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:43260216`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	23	A4,A6,B1,B125,B135,B16,B21,B25,B5,B57,B7,B8,C28,C36,C37,C49,C55,C58,C73,C74,D3,D6,D8
`Chr3:43260736`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr3:43260887`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B1
`Chr3:43260887`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B1
`Chr3:43260894`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,D10
`Chr3:43261125`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:43261158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C82
`Chr3:43261167`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A2,C82
`Chr3:43261167`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A2,C82
`Chr3:43261647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C21
`Chr3:43261647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr3:43261886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800364.1

401 aa

200

401

PAE

PF03283 PAE 28-394 aa

XP_057800365.1

312 aa

156

312

PAE

PF03283 PAE 28-280 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800364.1`	Pfam	`PF03283`	PAE	Family	28	394	1.9e-118	396.5	Pectinacetylesterase
`XP_057800365.1`	Pfam	`PF03283`	PAE	Family	28	280	3.9e-101	339.5	Pectinacetylesterase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944381.1
ACTAGTCATGGCTCAATTTGTGTTGCTCATCATCTTCATCTTCTCTCTCAATATTGCACTGCAAAGCTGTGGTGTCGACGGCGCTCGCAACATTTCCATAACTCTGTTGAAGAATGCTCTTGCCAAAGGAGCAGTTTGCCTTGACGGCAGCCCTCCCGCTTATGCCTACAGTCGAGGATTTGGAGATGGAGCAGACAACTGGCATGTCTATTTACAGGGTGGTGGGTGGTGTGACTCAAGAGGTTCTTGCTTGGATAGAT...

XM_057944382.1
ACTAGTCATGGCTCAATTTGTGTTGCTCATCATCTTCATCTTCTCTCTCAATATTGCACTGCAAAGCTGTGGTGTCGACGGCGCTCGCAACATTTCCATAACTCTGTTGAAGAATGCTCTTGCCAAAGGAGCAGTTTGCCTTGACGGCAGCCCTCCCGCTTATGCCTACAGTCGAGGATTTGGAGATGGAGCAGACAACTGGCATGTCTATTTACAGGGTGGTGGGTGGTGTGACTCAAGAGGTTCTTGCTTGGATAGAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015892
ATGGCTCAATTTGTGTTGCTCATCATCTTCATCTTCTCTCTCAATATTGCACTGCAAAGCTGTGGTGTCGACGGCGCTCGCAACATTTCCATAACTCTGTTGAAGAATGCTCTTGCCAAAGGAGCAGTTTGCCTTGACGGCAGCCCTCCCGCTTATGCCTACAGTCGAGGATTTGGAGATGGAGCAGACAACTGGCATGTCTATTTACAGGGTGGTGGGTGGTGTGACTCAAGAGGTTCTTGCTTGGATAGATCCAAAAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057800364.1
MAQFVLLIIFIFSLNIALQSCGVDGARNISITLLKNALAKGAVCLDGSPPAYAYSRGFGDGADNWHVYLQGGGWCDSRGSCLDRSKNEYGSSTVIMATRNGTITFRGMLADNSTFNPDFYNWNVVYIFYCDGSSFMSDIEEVDPVHNLTYRGGRIYEAMMDELLRMGMGNAKNALLSGTSAGGLATILHCDKFQALFPDSTRVKCLSDSGFFIRGQYFTGADLREGRFYGVVKTNKLENLLPTSCTTKFNPILCFFPENL...

XP_057800365.1
MAQFVLLIIFIFSLNIALQSCGVDGARNISITLLKNALAKGAVCLDGSPPAYAYSRGFGDGADNWHVYLQGGGWCDSRGSCLDRSKNEYGSSTVIMATRNGTITFRGMLADNSTFNPDFYNWNVVYIFYCDGSSFMSDIEEVDPVHNLTYRGGRIYEAMMDELLRMGMGNAKNALLSGTSAGGLATILHCDKFQALFPDSTRVKCLSDSGFFIRGQYFTGADLREGRFYGVVKTNKLENLLPTSCTTKFNPILCFFPENL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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