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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002736`

染色体: Chr03 坐标: 43490514-43494438 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002736`
名称	SmilChr03G002736
描述	protein SOSEKI 1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	43490514 - 43494438 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015914`
GeneID	`131015914`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015914`
原始查询	`LOC131015914`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SOSEKI 1-like
产物	protein SOSEKI 1-like
Arabidopsis	`AT1G05577` (AT1G05577) UPSTREAM OF FLC protein (DUF966) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837062] identity=36.8; qcov=0.991; evalue=6.82e-60; confidence=medium
Rice	`Os01g0778100` (OsDSR1) - identity=33.8; qcov=0.986; evalue=1.17e-53; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06136 (SOK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015914

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057800386.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057800386.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800386.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800386.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800386.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:43490628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,B50,B60
`Chr3:43490834`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B139,B140,B4,B64,B84,C18,C2,C84
`Chr3:43490887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B135
`Chr3:43490896`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B48
`Chr3:43490912`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr3:43490914`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:43490915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:43490920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B78,B8
`Chr3:43491097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B135
`Chr3:43491125`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B135
`Chr3:43491186`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C8
`Chr3:43491186`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800386.1

380 aa

190

380

SOK

PF06136 SOK 63-149 aa

XP_057800387.1

345 aa

172

345

SOK

PF06136 SOK 28-114 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800386.1`	Pfam	`PF06136`	SOK	Domain	63	149	6.8e-30	103.9	SOSEKI protein DIX-like domain
`XP_057800387.1`	Pfam	`PF06136`	SOK	Domain	28	114	5.9e-30	104.1	SOSEKI protein DIX-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944403.1
AGCTTGAGATCTCGATCAACTTGGGTTGGTGATATAGACCATATATATTCCTAATTGCTTAATAACATGCATATGGATTTGTTGGCTTCATATAATATAATATACTATATTAATATAAGACAGGTATTTTGTATCATTCACCACTACGGGATGTGTGTGTATATATATAAATTCCCATTGTGGAGTCACAGCTGAAACGGCACGCACGTTTCTGGCCTTTCTCTATATTTGAACATCATTTGAATATCAAAGGTAATACT...

XM_057944404.1
TTCATATAATATAATATACTATATTAATATAAGACAGGTATTTTGTATCATTCACCACTACGGGATGTGTGTGTATATATATAAATTCCCATTGTGGAGTCACAGCTGAAACGGCACGCACGTTTCTGGCCTTTCTCTATATTTGAACATCATTTGAATATCAAAGGTAATTGAAGTACATAAATGGTGGAAATATACTGAGTTTGATTTAATTCTGCTTTTGGTCTGGAAATTTTGCGCGAAGATGGATACTGATTTTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015914
ATGGCTTCAAGAAAAGAATCAGCAGCTGTAATTGAAGTACATAAATGGTGGAAATATACTGAGTTTGATTTAATTCTGCTTTTGGTCTGGAAATTTTGCGCGAAGATGGATACTGATTTTCACAACGGAAGAATAGTTAAAAGGAGAACAATGGAGGCACAAGGTGGTGCAGAAGTGAGGCGACTTCACATCCTATACTTTTTAAGTCGAAAGGGTCGGAACGAACATCCTCATCTCATTCGAATCCATCATCTCTCCAA...

LOC131015914
ATGGATACTGATTTTCACAACGGAAGAATAGTTAAAAGGAGAACAATGGAGGCACAAGGTGGTGCAGAAGTGAGGCGACTTCACATCCTATACTTTTTAAGTCGAAAGGGTCGGAACGAACATCCTCATCTCATTCGAATCCATCATCTCTCCAATAATGGTGTTCGATTGAGAGACATCAAGAGATGGTTGGGAGAATTGCGAGGAAAAGACATGCCAGAATCATTTGCTTGGTCTTACAAGAGGACATACAAGACAGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057800386.1
MASRKESAAVIEVHKWWKYTEFDLILLLVWKFCAKMDTDFHNGRIVKRRTMEAQGGAEVRRLHILYFLSRKGRNEHPHLIRIHHLSNNGVRLRDIKRWLGELRGKDMPESFAWSYKRTYKTGYVWQDILDDDLLTPISDNEYVLKGSEISSTNHNIDLSAHKEQTRAQESANHSERASSNIHSSDSFNDVSSKTPSFGSETSSSTDDSLRKHTIDETSSDRSNQESVSNEKKRKTNKLEIINAKSSVSKTADKPPHHRKT...

XP_057800387.1
MDTDFHNGRIVKRRTMEAQGGAEVRRLHILYFLSRKGRNEHPHLIRIHHLSNNGVRLRDIKRWLGELRGKDMPESFAWSYKRTYKTGYVWQDILDDDLLTPISDNEYVLKGSEISSTNHNIDLSAHKEQTRAQESANHSERASSNIHSSDSFNDVSSKTPSFGSETSSSTDDSLRKHTIDETSSDRSNQESVSNEKKRKTNKLEIINAKSSVSKTADKPPHHRKTTHSSGMFRSFISCGGVDTNDSVVLMASKRYKPFLK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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