当前解析结果
SmilChr01G000284| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000284 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000284 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000284 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 5576383 - 5581778 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131015966 |
|---|---|
| GeneID | 131015966 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131015966 |
| 原始查询 | LOC131015966 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os02g0724600; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os02g0724600; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT4G26600 (AT4G26600)S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828767] identity=41.3; qcov=0.452; evalue=3.1e-09; confidence=low |
| Rice | Os02g0724600- identity=48; qcov=0.44; evalue=1.92e-13; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131015966 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057800469.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057800535.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057800543.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057800469.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057800469.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:5578171 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | B127,B18,B49,B53,B77,C56 |
Chr1:5578186 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C43,D8 |
Chr1:5578222 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B95,C29 |
Chr1:5578223 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B71,C51,C77 |
Chr1:5578238 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B43,B87 |
Chr1:5578240 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C11,C60,C69 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
10 records
下载 cDNA FASTA10 records
下载 CDS FASTA10 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。