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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002799`

染色体: Chr03 坐标: 44482541-44486316 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002799`
名称	SmilChr03G002799
描述	transcription factor bHLH130-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	44482541 - 44486316 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015967`
GeneID	`131015967`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015967`
原始查询	`LOC131015967`

查看完整 ID 对照表

已核对的文献基因名映射

这些条目来自人工核对的文献基因名与当前参考基因组的映射。置信度反映映射证据强度，不代表该功能已在本材料中完成实验验证。

文献基因名	映射置信度	映射证据	文献功能摘要
`SmbHLH60`	medium	BLASTP against website protein; top hit 65.63% identity, 99% query coverage	Regulates phenolic acids and anthocyanins; antagonistic relationship with SmMYC2.

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor bHLH130-like
产物	transcription factor bHLH130-like
Arabidopsis	`AT2G42280` (FBH4) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818829] identity=40.1; qcov=0.924; evalue=4.99e-60; confidence=medium
Rice	`Os08g0506700` (OsFBH1) - identity=57; qcov=0.401; evalue=2.59e-49; confidence=low
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0005634 (nucleus); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015967

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800465.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800465.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800465.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800465.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057800465.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:44483970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B122,B33
`Chr3:44483970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B33
`Chr3:44484007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B108,C23
`Chr3:44484007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr3:44484059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,C6
`Chr3:44484222`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B13,B59,C19,C3
`Chr3:44484224`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C55
`Chr3:44484224`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C55
`Chr3:44484258`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B123,B77,C48
`Chr3:44484309`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr3:44484323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr3:44484439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800466.1

400 aa

200

400

HLH

PF00010 HLH 323-368 aa

XP_057800467.1

394 aa

197

394

HLH

PF00010 HLH 323-368 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800466.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	323	368	1.3e-08	35.2	Helix-loop-helix DNA-binding domain
`XP_057800467.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	323	368	1.4e-08	35.1	Helix-loop-helix DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009098806.1
CGCACAACAAAGACCGGATGCAACGCACCAATTCGACAATTTGACCTTTCACGTGTTGAATTCGATAATTCCGTCGCCCTATATATACCACATGTGCCTCACCCGCACTTCACCGCAACTTCCCTTTTCGTCTGTCGACAGCATTCAATCTCATTTCCTTTTTCAAGAAACAATCCCATATCCTTTGAATCCACTGCTTCTCGGAGTTTCCATTAATGTTCTCCGCCACCTTCCACACATAGAAACCTAGTCTTCTCTAG...

XM_057944484.1
TTTAAAAAAAATGATGAGATGACGTGGAGCGAGTGACATGGCAAATGGATATATACGCGTAAAATGGGAGTCATTTTTAGTCTCGCACAACAAAGACCGGATGCAACGCACCAATTCGACAATTTGACCTTTCACGTGTTGAATTCGATAATTCCGTCGCCCTATATATACCACATGTGCCTCACCCGCACTTCACCGCAACTTCCCTTTTCGTCTGTCGACAGCATTCAATCTCATTTCCTTTTTCAAGAAACAATCCC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131015967
ATGTTCAGCTCAGACACCATCTCCAGAGACTTCCTTCACTCCAATGCCAATCCCTCTCACCACACCAATTTCAAGCATGTCTCAGCTGATGCCGAATTCTCAAAGAGCAGAGAATTCATGCCCTCGGATTTCTTCAACAATCAGCAGCAGCACAGCTCCGGACTAGCTCGATATCGGTCGGCGCCGAGCTCGTTGTTCGCGGCCCTTCTGGATTCCAACACCGATAACAACAGCAGCAGCGGCGATGAATCAGACGCTTT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057800465.1
MFSSDTISRDFLHSNANPSHHTNFKHVSADAEFSKSREFMPSDFFNNQQQHSSGLARYRSAPSSLFAALLDSNTDNNSSSGDESDAFFSALIERDLNPKSSDHQISSGMKREDGAEADPRPAQNGYDAVTGSYSVGMEHHVDLRLRDENGNRSNLLRQSSSPAGFFNGFGVMGEAGDYRVPNPAEDSSSVGGLSSSMNLTSAASSSSRFMPSIPETGNQDAFSPENGRLRNEPTFQHDSWNETSFNSLKRNRDGDSKMFS...

XP_057800466.1
MFSSDTISRDFLHSNANPSHHTNFKHVSADAEFSKSREFMPSDFFNNQQQHSSGLARYRSAPSSLFAALLDSNTDNNSSSGDESDAFFSALIERDLNPKSSDHQISSGMKREDGAEADPRPAQNGYDAVTGSYSVGMEHHVDLRLRDENGNRSNLLRQSSSPAGFFNGFGVMGEAGDYRVPNPAEDSSSVGGLSSSMNLTSAASSSSRFMPSIPETGNQDAFSPENGRLRNEPTFQHDSWNETSFNSLKRNRDGDSKMFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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