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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002802`

染色体: Chr03 坐标: 44500072-44508118 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002802`
名称	SmilChr03G002802
描述	acetyl-coenzyme A synthetase, chloroplastic/glyoxysomal
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	44500072 - 44508118 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015973`
GeneID	`131015973`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015973`
原始查询	`LOC131015973`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	acetyl-coenzyme A synthetase, chloroplastic/glyoxysomal
产物	acetyl-coenzyme A synthetase%2C chloroplastic/glyoxysomal
Arabidopsis	`AT5G36880` (ACS) acetyl-CoA synthetase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833655] identity=81.9; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0525900` - identity=80.3; qcov=0.999; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003987 (acetyl-CoA synthetase activity); GO:0016208 (AMP binding); GO:0019427 (GO:0019427)
KEGG	smil00010 (Glycolysis / Gluconeogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00620 (Pyruvate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00630 (Glyoxylate and dicarboxylate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00640 (Propanoate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00501 (AMP-binding); PF13193 (AMP-binding_C); PF16177 (ACAS_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015973

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057800474.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057800474.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057800474.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800474.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800474.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:44500356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,C25
`Chr3:44501312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:44501420`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr3:44502178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr3:44502185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A6,B50,C33
`Chr3:44503159`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr3:44504459`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr3:44504474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:44504686`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr3:44504860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B58,B59,C31
`Chr3:44506947`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr3:44506995`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800474.1

696 aa

348

696

ACAS_N

AMP-binding

AMP-binding_C

PF16177 ACAS_N 63-123 aa PF00501 AMP-binding 129-518 aa PF13193 AMP-binding_C 580-658 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800474.1`	Pfam	`PF16177`	ACAS_N	Family	63	123	1.1e-18	67.5	Acetyl-coenzyme A synthetase N-terminus
`XP_057800474.1`	Pfam	`PF00501`	AMP-binding	Family	129	518	1.2e-92	311.4	AMP-binding enzyme
`XP_057800474.1`	Pfam	`PF13193`	AMP-binding_C	Domain	580	658	9.4e-25	88.1	AMP-binding enzyme C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944491.1
TTGATTTTATATCTTCTTCCTCTTCCTCTATATATATTAACAGTTTTAGTGATTTTATATCCCAACCGTGTTTGGTGCGTGAGCCTCGGCCTCCCCTATTATTATCATTATTATATGATACGAATAGTATTACTAATAGTAATCTTGGGATTTCAATTGCAAAGTCCAAGCTAGCTTCCGAGTCTCAGTCAAGAATACCTTCTGCCGCCTTGGTCAACCTTCGCCGTCGATCTCCCGCCATGGCCGATACACTCCCCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015973
ATGGCCGATACACTCCCCAACGCCGCTGGATCTTCTTACCATCTTCGCCACGTCCACTCTATGTCCTCCGCCGCCTCCCGATCGAATACCGTCATCCTCGGCGACGCCCTTGCTTCCGAGGAGCACGATCTCGTCGTCTCCAATCCGGATTTCTCTGCCCAGGCTCTCGTTCCCTCCCCCGACAAGTATCTCGAAATGTACAAACGGTCCATTGAGGACCCTGCCGGATTCTGGTCCGACATTGCTTCCCAGTTCTACTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800474.1
MADTLPNAAGSSYHLRHVHSMSSAASRSNTVILGDALASEEHDLVVSNPDFSAQALVPSPDKYLEMYKRSIEDPAGFWSDIASQFYWKQKWGTPVYSENFDVRKGRINIEWFKGGMTNICYNCVDANIAAGNGEKIAIYWEGNELGVDATLTYNQLLHKVCQLANYLKDIGVRKGDAVLIYLPMLMELPIAMLACARIGAVHSIVFAGFSSESLSQRIADCKPKVVLTCNAVKRGPKVIHLKDIVDTSLADSAKNGTVVD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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