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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002866`

染色体: Chr03 坐标: 45274578-45279542 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002866`
名称	SmilChr03G002866
描述	probable metal-nicotianamine transporter YSL6
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	45274578 - 45279542 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015978`
GeneID	`131015978`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015978`
原始查询	`LOC131015978`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable metal-nicotianamine transporter YSL6
产物	probable metal-nicotianamine transporter YSL6
Arabidopsis	`AT3G27020` (YSL6) YELLOW STRIPE like 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822319] identity=81; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0390500` (OsYSL6) - identity=74.6; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005774 (vacuolar membrane); GO:0035673 (oligopeptide transmembrane transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF03169 (OPT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015978

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057800486.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057800486.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057800486.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800486.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800486.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:45275695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr3:45276063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B104,B29,B80
`Chr3:45277518`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr3:45279025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B104,B29,B81
`Chr3:45279118`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800486.1

672 aa

336

672

OPT

PF03169 OPT 35-653 aa

XP_057800487.1

672 aa

336

672

OPT

PF03169 OPT 35-653 aa

XP_057800488.1

672 aa

336

672

OPT

PF03169 OPT 35-653 aa

XP_057800489.1

670 aa

335

670

OPT

PF03169 OPT 35-651 aa

XP_057800490.1

670 aa

335

670

OPT

PF03169 OPT 35-651 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800486.1`	Pfam	`PF03169`	OPT	Family	35	653	7.9e-152	507.8	OPT oligopeptide transporter protein
`XP_057800487.1`	Pfam	`PF03169`	OPT	Family	35	653	7.9e-152	507.8	OPT oligopeptide transporter protein
`XP_057800488.1`	Pfam	`PF03169`	OPT	Family	35	653	7.9e-152	507.8	OPT oligopeptide transporter protein
`XP_057800489.1`	Pfam	`PF03169`	OPT	Family	35	651	1.4e-151	507.0	OPT oligopeptide transporter protein
`XP_057800490.1`	Pfam	`PF03169`	OPT	Family	35	651	1.4e-151	507.0	OPT oligopeptide transporter protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

10 records

下载 cDNA FASTA

XR_009098812.1
TCGAGCATTGGGCCCAATGATTTGGAGGAAACGTGAATAATGAAGTAAACAACGAGAAAACCAAACTCACATATCTAATCCCTCACTCCACTCCATTTCTCAACTACCAAAAACACAAACCCCATTTCTTCACTGTCGGAGCATCCGATTTCGGAACACTCGGGTCAATGGGAACGGCGGCGGCTGAGGTGGAGATATCGGAGCCTCTTCTACAGCAGGATGAGGCGGCGGCGCCCGATTTGGACGAGCCGATTCCCGAC...

XR_009098813.1
TCGAGCATTGGGCCCAATGATTTGGAGGAAACGTGAATAATGAAGTAAACAACGAGAAAACCAAACTCACATATCTAATCCCTCACTCCACTCCATTTCTCAACTACCAAAAACACAAACCCCATTTCTTCACTGTCGGAGCATCCGATTTCGGAACACTCGGGTCAATGGGAACGGCGGCGGCTGAGGTGGAGATATCGGAGCCTCTTCTACAGCAGGATGAGGCGGCGGCGCCCGATTTGGACGAGCCGATTCCCGAC...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC131015978
ATGGGAACGGCGGCGGCTGAGGTGGAGATATCGGAGCCTCTTCTACAGCAGGATGAGGCGGCGGCGCCCGATTTGGACGAGCCGATTCCCGACTGGAAGGAGCAGATTACGATCAGAGGGCTGGTGGTCAGCGCCGTGTTGGGCGCTCTCTTCTGCATAATCACGCACAAGCTCAATCTCACGGTCGGGATCATCCCGTCGCTCAACGTCGCCGCCGGTTTGCTCGGCTTCTTCTCCGTCAAATCGTGGACCGGGTTTTT...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057800486.1
MGTAAAEVEISEPLLQQDEAAAPDLDEPIPDWKEQITIRGLVVSAVLGALFCIITHKLNLTVGIIPSLNVAAGLLGFFSVKSWTGFLSKLGFSSKPFTRQENTVIQTCVVACYGLAFSGGFGSYLLSMDEKTYKLIGEDYPGNHAEDVKNPGLLWMMAFIFVVSFLGLFSLVPLRKVMVLDYKLTYPSGTATAMLINSFHTRTGAELAKKQVNSLGKYLSISFCWSFFKWFFSGIGDSCGFDNFPTFGLALFNNTFYFDF...

XP_057800487.1
MGTAAAEVEISEPLLQQDEAAAPDLDEPIPDWKEQITIRGLVVSAVLGALFCIITHKLNLTVGIIPSLNVAAGLLGFFSVKSWTGFLSKLGFSSKPFTRQENTVIQTCVVACYGLAFSGGFGSYLLSMDEKTYKLIGEDYPGNHAEDVKNPGLLWMMAFIFVVSFLGLFSLVPLRKVMVLDYKLTYPSGTATAMLINSFHTRTGAELAKKQVNSLGKYLSISFCWSFFKWFFSGIGDSCGFDNFPTFGLALFNNTFYFDF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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