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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002806`

染色体: Chr03 坐标: 44519219-44525029 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002806`
名称	SmilChr03G002806
描述	probable magnesium transporter NIPA8
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	44519219 - 44525029 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015987`
GeneID	`131015987`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015987`
原始查询	`LOC131015987`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable magnesium transporter NIPA8
产物	probable magnesium transporter NIPA8
Arabidopsis	`AT3G26670` (AT3G26670) magnesium transporter, putative (DUF803) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822279] identity=68.1; qcov=0.989; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0518100` - identity=63.5; qcov=0.95; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0015095 (magnesium ion transmembrane transporter activity); GO:0015693 (magnesium ion transport); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF05653 (Mg_trans_NIPA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015987

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057800505.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057800505.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057800505.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800505.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800505.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:44519510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B131,B35,B46
`Chr3:44519682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B8,C73
`Chr3:44519703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr3:44520054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,B76,C77
`Chr3:44522611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32
`Chr3:44524166`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B8
`Chr3:44524166`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800505.1

444 aa

222

444

Mg_trans_NIPA

PF05653 Mg_trans_NIPA 7-310 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800505.1`	Pfam	`PF05653`	Mg_trans_NIPA	Family	7	310	2.9e-22	79.9	Magnesium transporter NIPA

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944522.1
GTCCCTTGTACCGACAGTTGGGCAATACAGATCGATAAAGTGTCACGTATATGCTTTGGCACGCAAAATTGACCCCTAATTTTTCTCTTTTTAATTAAATCAAAATATTTGGAAAAACAGAAGACGCTTCTTCCTCAAACACGACGGCCAGCTTGAGTTGCCGTCGAAGAATTTTCATTTTGTCTTCCCCTTTCTCTCTCCTCCCCCCTTCCTCTCTCCCTCTCTCTCTTTGGCAAACAAGCATTATAAGAATTTGAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015987
ATGGGGGAGTGGGTTGTTGGAGCGTTCATCAACCTTTTCGGCAGCATTGCAATCAACTTTGGAACTAACCTCCTTAAATTGGGTCATGATGAGAGAGAGAAACATTCTATAGTTGGCAATGATGGGACAAGTGGAAAAGCTTTCACAAAGCCTATTATATACTTCCAGACGTGGAGAATTGGGATTATCTTTTTTATTCTCGGAAATTCTCTTAATTTCATTTCCTTTGGCTATGCCGCTCAGTCCCTTCTTGCAGCTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800505.1
MGEWVVGAFINLFGSIAINFGTNLLKLGHDEREKHSIVGNDGTSGKAFTKPIIYFQTWRIGIIFFILGNSLNFISFGYAAQSLLAALGSVQFVSNIAFAFFVLNKTVAVKVLVATAFIVLGNIFLVAFGNHQSPVYTPEQLAEKYGNTTFLIYCLILVIVVLLSHSMYRRGELMFAMPGNEIKPYWQMLLPLSYALVSGAIGSCSVLFAKSLSNLLRLSMSNGYQLHSWFTYSMLLLFFSTAGFWMARLNEGLSLFDAIL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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