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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002809`

染色体: Chr03 坐标: 44543472-44550483 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002809`
名称	SmilChr03G002809
描述	zerumbone synthase-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	44543472 - 44550483 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016000`
GeneID	`131016000`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016000`
原始查询	`LOC131016000`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zerumbone synthase-like
产物	zerumbone synthase-like
Arabidopsis	`AT3G26760` (AT3G26760) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822289] identity=62.8; qcov=0.876; evalue=1.39e-120; confidence=high
Rice	`Os11g0523110` - identity=60.8; qcov=0.863; evalue=1.42e-102; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00106 (adh_short); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016000

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057800527.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057800527.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800527.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800527.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800527.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:44543697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr3:44543912`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:44544016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr3:44544206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B40
`Chr3:44544246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr3:44544281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B80
`Chr3:44544297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr3:44544299`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,C77
`Chr3:44550285`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B48
`Chr3:44550285`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800527.1

307 aa

154

307

adh_short

adh_short_C2

PF00106 adh_short 47-235 aa PF08659 KR 49-208 aa PF13561 adh_short_C2 55-296 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800527.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	47	235	8.5e-44	150.1	short chain dehydrogenase
`XP_057800527.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	49	208	4.1e-10	40.6	KR domain
`XP_057800527.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	55	296	2.3e-57	195.0	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944544.1
GAGAGAGAGAGACTGGCCGGGCCGGGCTGGACTGGGCCCCATTACATATCCTACCTAATATTCTTCCCCTCCCACCTCCCTCCCCACATATTATATATCGTTTTTCACAACACACGTAAAAACAAAACCATATATGATATATATACAGAGAGAGAGAGAGAGGTGTTATTGTAGTAGTAATGAGAAGTTTGGTCTGGGAGAAACAGAGTGCTAAGCTAGGGTTGGAAATGCTTAGATTACTGAGCAGATGCACATCACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016000
ATGAGAAGTTTGGTCTGGGAGAAACAGAGTGCTAAGCTAGGGTTGGAAATGCTTAGATTACTGAGCAGATGCACATCACATTCACAAAAGCAGATTAGAAGGAGGTTTTCCAGCACCGCTTCTCTACGCCTTGAAGGCAAGGTAGCTCTCATAACCGGTGGCGCTAGCGGGCTTGGAAAGGCTACGGCACATGCATTCATCCAACAAGGCGCCCATGTCGTGATTGCCGATATCAATACCCAATTGGGCCCTCAGGCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800527.1
MRSLVWEKQSAKLGLEMLRLLSRCTSHSQKQIRRRFSSTASLRLEGKVALITGGASGLGKATAHAFIQQGAHVVIADINTQLGPQASRDLGPQAHFVPCDVAVEAHISDAVDLAVARHGKLDVMCNIAGIVGSAFPPSIVDLELHEFDRVMAVNVRGTMAGIKHAARVMVPAGSGSILCTASISGLLGGCGPHPYTVSKFAIPGMVKSLASELCGHGVRINCISPSPIPTPLVVEQLRKIMPSATRDEIVGMIKGLGELK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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