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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002862`

染色体: Chr03 坐标: 45233810-45235728 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002862`
名称	SmilChr03G002862
描述	transcription factor TCP20
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	45233810 - 45235728 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016002`
GeneID	`131016002`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016002`
原始查询	`LOC131016002`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor TCP20
产物	transcription factor TCP20
Arabidopsis	`AT3G27010` (TCP20) TEOSINTE BRANCHED 1, cycloidea, PCF (TCP)-domain family protein 20 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822318] identity=58.9; qcov=0.809; evalue=1.9e-75; confidence=high
Rice	`Os01g0924400` (OsTCP6) - identity=45.3; qcov=0.852; evalue=5.46e-52; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03634 (TCP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016002

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800530.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800530.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800530.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800530.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057800530.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:45234335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr3:45234438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B124,C60,C8,D11
`Chr3:45234528`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr3:45234584`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A25
`Chr3:45234584`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A25
`Chr3:45234604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B3,C87
`Chr3:45234616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B29,B44,B81
`Chr3:45234724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:45234730`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800530.1

298 aa

149

298

TCP

PF03634 TCP 54-196 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800530.1`	Pfam	`PF03634`	TCP	Family	54	196	4.3e-27	96.3	TCP family transcription factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944547.1
TAAATTATTAGCATTATCCCTTTGCCTTTTGTTCAACAGATGATAGTGTGAGTCTTAAGTAACCCCACAATCCCAATCATTTCTTACCAGGTGTTCTTATGCAATCTCTCCATAATATTTATATTTATATATATATATATATACATGTGTGTGTGTGTGTGAGTTTTAGCCTCTTGCAAAATATTGCACCAAAATTACTCATTTTTGTTGGTTGTAATAATACAACCAAGCTACAAGTGAGAAGAATAGTTCTTACAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016002
ATGGATCCGAAGAACTCAAAGCAGCCGCAGGAGATGGCGAACCACAGCAGCAACAACAACAACGCAGGTGAAATCAAAGGTGCAGAGATGAAGGATTTCCAGATTGTAGTGGCGGAAAAAGACGAGTCCAAGAAGCACGCTCTGGCTCCGAAGCGGAGCTCCAACAAGGATCGCCACACCAAAGTCGAGGGCCGCGGCCGCCGAATTCGGATGCCCGCCCTCTGCGCCGCTAGAATCTTCCAATTAACCAGAGAATTAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800530.1
MDPKNSKQPQEMANHSSNNNNAGEIKGAEMKDFQIVVAEKDESKKHALAPKRSSNKDRHTKVEGRGRRIRMPALCAARIFQLTRELGHKSDGETIQWLLQQAEPSIIAATGSGTIPASALAAAGGAISQQATSISSGLHQKIEDLGVTMGGGRSPWPMIGGNLGRPHVGVSTGLWPPAGFGFQTSSSSSSSSGPSMAAENPSYLQKMGFPGFELPGGNMGPMSFTSILSGGAQQLPGLELGLSQDGNIGVLNPQAFGQFY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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