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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002859`

染色体: Chr03 坐标: 45195313-45197354 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002859`
名称	SmilChr03G002859
描述	60S ribosomal protein L7a-2
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	45195313 - 45197354 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016008`
GeneID	`131016008`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016008`
原始查询	`LOC131016008`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L7a-2
产物	60S ribosomal protein L7a-2
Arabidopsis	`AT3G62870` (AT3G62870) Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825462] identity=82.9; qcov=0.996; evalue=2.98e-160; confidence=high
Rice	`Os09g0507800` (surf-3) - identity=87.2; qcov=0.996; evalue=9.27e-169; confidence=high
GO	GO:0042254 (ribosome biogenesis); GO:1990904 (ribonucleoprotein complex)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01248 (Ribosomal_L7Ae)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016008

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057800540.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057800540.1`
3	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057800540.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057800540.1`
5	Nucleolus rim	Nucleolus rim	0.20000	`XP_057800540.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:45195688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:45196427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr3:45196527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr3:45197076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr3:45197108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800540.1

258 aa

129

258

Ribosomal_L7Ae

PF01248 Ribosomal_L7Ae 115-206 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800540.1`	Pfam	`PF01248`	Ribosomal_L7Ae	Domain	115	206	2.7e-26	91.8	Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944557.1
TCAACTCTATCGAATCGTCAAATTATTTGATTATGAATTATTCGAGTAGAAATTTTATTGAGTTAAACTTTTTTAACCTCGATTTTCTTAAATTTTGAGTTGTCGGTCTATTTGGGCCAACCCACTCGAGTAAGATCCATATGATTTTTACGAAATTGAAGGGGTTATTATTCACTACTTCTACTTCTGTTGAGGTATATAATTTAGGGTTTCGCAGCCGTTTGTAAACCCTCTCACAGTCTCACTCATTTCATCGCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016008
ATGGCGCCGAAGAAGGGTGCGAAGCTTCCGGCAGCTGCCAAGAAGAAGGCGGAGAAAGTTGTTAACCCGCTGTTCGAGAAGAGGCCAAAGCAATTCGGGATCGGCGGCGCCCTCCCACCTAAGAAGGATCTTCACAGGTTTGTGAGATGGCCGCAAGTCGTGCGGATTCAGCGCAAGAAGATGATCTTGAAGCAGCGCTTGAAGGTGCCGCCGCCAATTCACCAGTTCTCGAAAACCCTGGACAAGAATTTGGCAACTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800540.1
MAPKKGAKLPAAAKKKAEKVVNPLFEKRPKQFGIGGALPPKKDLHRFVRWPQVVRIQRKKMILKQRLKVPPPIHQFSKTLDKNLATSLFKMLLKYRPEDRAQKKERLLKRAQAEAEGKTPETKKPIVVKYGLNHVTYLIEQNKAQLVVIAHDVDPIELVVWLPALCRKMEIPYCIVKGKARLGSIVHKKTASVLCLTSVKNEDKMEFSKILEAIKANFNDKYDETRKKWGGGVMGSKSQAKTKAKERVLAKEAAQRII

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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