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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002847`

染色体: Chr03 坐标: 45029734-45034179 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002847`
名称	SmilChr03G002847
描述	transcription initiation factor TFIID subunit 7-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	45029734 - 45034179 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016012`
GeneID	`131016012`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016012`
原始查询	`LOC131016012`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription initiation factor TFIID subunit 7-like
产物	transcription initiation factor TFIID subunit 7-like
Arabidopsis	`AT1G55300` (TAF7) TBP-associated factor 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841975] identity=64.1; qcov=1.03; evalue=2.1e-88; confidence=high
Rice	`Os05g0347000` - identity=62.4; qcov=1.02; evalue=4.45e-67; confidence=high
GO	GO:0005669 (transcription factor TFIID complex); GO:0006367 (transcription initiation at RNA polymerase II promoter); GO:0016251 (RNA polymerase II general transcription initiation factor activity); GO:0051123 (RNA polymerase II preinitiation complex assembly)
KEGG	smil03022 (Basal transcription factors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04658 (TAFII55_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016012

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800547.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057800547.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800547.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800547.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800547.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:45030106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr3:45030837`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C3,C9
`Chr3:45030837`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C3,C9
`Chr3:45030877`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	A8,B103,B128,B15,B21,B52,B53,B94,C31,C4,C49,C57,C61,C72
`Chr3:45030880`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	14	A8,B103,B128,B15,B21,B52,B53,B94,C31,C4,C49,C57,C61,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800547.1

200 aa

100

200

TAFII55_N

PF04658 TAFII55_N 1-139 aa

XP_057800548.1

200 aa

100

200

TAFII55_N

PF04658 TAFII55_N 1-139 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800547.1`	Pfam	`PF04658`	TAFII55_N	Family	1	139	1.7e-33	116.3	TAFII55 protein conserved region
`XP_057800548.1`	Pfam	`PF04658`	TAFII55_N	Family	1	139	1.7e-33	116.3	TAFII55 protein conserved region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944565.1
TTTCGTTTTTAATTTGTGTATCGCGGCCTCTGCCTCGCTCTGCTCTCAATCAAGTCACCCGCGCCTTCGAATCCGACGCAGCGTCGGCGACGCTCCCCCCGCCCCACCTCCGCCCTCCGCCTCCTTGAATGCCTAATTAAACAGCCCGCCGCTCCTCCCCTGTCGGCCGGTCTTCCTCCTCCAGTCGGCAGTCGCACCCTCAGACGCCTTAGAATCTCAGATTTTGTTGGGATTTGACAAAAGATAAGAGGTATTGTTTG...

XM_057944564.1
TTCGTTTTTAATTTGTGTATCGCGGCCTCTGCCTCGCTCTGCTCTCAATCAAGTCACCCGCGCCTTCGAATCCGACGCAGCGTCGGCGACGCTCCCCCCGCCCCACCTCCGCCCTCCGCCTCCTTGAATGCCTAATTAAACAGCCCGCCGCTCCTCCCCTGTCGGCCGGTCTTCCTCCTCCAGTCGGCAGTCGCACCCTCAGACGCCTTAGAATCTCAGATTGTAGTTGTTGGGATTTGACAAAAGATAAGAGGTATTGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016012
ATGGAAGAGCAGTTTATACTGAGAGTGCCACCAGCTGTTGCCGAAAGAATTGAGCGGCTCTTAAATGATTCATCTGCTTCTTCTGAAGACAAGAACTTGGATATGGTGTTTTCTGAGGATGGAAGGACTGGTACATTTGTTATAGGAAATGACCGCTTCTCTTCTTCCCTCTTGGATCTTCCCTCTGTTGTAGAGTCATACAAGACTTATGATGACAATGTGTTGATTAAAACTGCAGACATTGGTCAAATGATAATGGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057800547.1
MEEQFILRVPPAVAERIERLLNDSSASSEDKNLDMVFSEDGRTGTFVIGNDRFSSSLLDLPSVVESYKTYDDNVLIKTADIGQMIMVREESDGVPEAVEYRHGLTPPMRDARRRRFRREPDLNPEVVRRVEKDLQNIMAGGTAENIGVEMVEPGEYGDEHARNANKQVASTPLAKPDAPEAETVGGEPDGSDSDETDDSM

XP_057800548.1
MEEQFILRVPPAVAERIERLLNDSSASSEDKNLDMVFSEDGRTGTFVIGNDRFSSSLLDLPSVVESYKTYDDNVLIKTADIGQMIMVREESDGVPEAVEYRHGLTPPMRDARRRRFRREPDLNPEVVRRVEKDLQNIMAGGTAENIGVEMVEPGEYGDEHARNANKQVASTPLAKPDAPEAETVGGEPDGSDSDETDDSM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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