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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002805`

染色体: Chr03 坐标: 44518243-44519190 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002805`
名称	SmilChr03G002805
描述	uncharacterized SmilChr03G002805
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	44518243 - 44519190 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016019`
GeneID	`131016019`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016019`
原始查询	`LOC131016019`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cotton fiber protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831235]; symbol=AT5G13880; hit=AT5G13880; species=arabidopsis; confidence=low
产物	cotton fiber protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831235]; symbol=AT5G13880; hit=AT5G13880; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G13880` (AT5G13880) cotton fiber protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831235] identity=35.5; qcov=1.06; evalue=1.09e-11; confidence=low
Rice	`Os04g0382400` - identity=25.1; qcov=1.13; evalue=2.71e-07; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05553 (DUF761)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016019

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057800555.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057800555.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800555.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800555.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800555.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:44518667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr3:44519001`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B1,B4,B5,B57,B7
`Chr3:44519001`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B1,B4,B5,B57,B7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800555.1

159 aa

159

DUF761

PF05553 DUF761 128-153 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800555.1`	Pfam	`PF05553`	DUF761	Family	128	153	8.6e-09	35.5	Cotton fibre expressed protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944572.1
CCTTTTCACAAATTACCATTATGTGTGAGGTAACTAATAATTATTGCCTTTATCTTTTCTCCTCGAGAATAACCCTTTATGTTTCTAATGTTTGCTTTCCTCTCCCCGTATTCTCTCGACTTTCCACTTTTACTTTGTTGAAGAAGAAATGGAGAGGGAGAGGGAGAGGCACTTCTTCCAATGCTTTTTATGTTTTTCCTTAGTGGTTACTCCATTAGTAGCACTCAAAATTTGTCATATATAATAAGTCCCCACTCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016019
ATGCTGAAGAAGATGATGGCGATGGTGGCATCCAAAGTTATGGCGATCAAGGATAGGATGAGAGCCATAGAGACTCAGCTCATGATACAATCGCTTCTCTTGCGGGACAAGAGGATGGTCCGCCACCTCTTCCGACGGAGGAATCACGTTAAGCAGTTGGACATAGTCCAGGAGGATGATGACAATTCAGAGTTTGTTGTAAACAGCTCCTCCGTTGCTACGTCTCCAGCCAGTGTGGTGCAGGTGGCAGAGGAGATTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800555.1
MLKKMMAMVASKVMAIKDRMRAIETQLMIQSLLLRDKRMVRHLFRRRNHVKQLDIVQEDDDNSEFVVNSSSVATSPASVVQVAEEIEDTMTMDMEDDDDMYSDPEHYSPLPEEEEEEEGEVSSELKLEDDIDKVADLFIQRFHHQIWLQKQHSDEGIHA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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