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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000291`

染色体: Chr01 坐标: 5688273-5690755 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000291`
名称	SmilChr01G000291
描述	chaperone protein ClpB4, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	5688273 - 5690755 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016022`
GeneID	`131016022`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016022`
原始查询	`LOC131016022`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chaperone protein ClpB4, mitochondrial-like
产物	chaperone protein ClpB4%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT2G25140` (CLPB4) casein lytic proteinase B4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817052] identity=81; qcov=1.02; evalue=1.01e-176; confidence=high
Rice	`Os02g0181900` (ClpB-m) - identity=78; qcov=0.987; evalue=2.64e-163; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0034605 (cellular response to heat)
KEGG	-
Pfam	PF17871 (AAA_lid_9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016022

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057800561.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057800561.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057800561.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800561.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800561.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:5688767`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	A4,B107,B37,B47,B61,B90,B92,C10,C47,C61
`Chr1:5689340`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	B129,B17,B66,C46,C63,C71,C9,D2
`Chr1:5689345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,C46,C63,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800561.1

308 aa

154

308

AAA_lid_9

PF17871 AAA_lid_9 64-150 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800561.1`	Pfam	`PF17871`	AAA_lid_9	Domain	64	150	1.1e-25	90.3	AAA lid domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944578.1
CTGGTCATCAAATAAACAACTGCTTTCTTGGGTTCAAGTGGTGACTTTGACATGTTCAAAATTTGCTATGAATAAGCTTGATGCTTCGACCTTGTAAATTCATTGTCTGATTAAACATCAAGTTATACTTCTCTATTACTGATCTGAAGAAGTTACCTTCTGGATATATGGTTAAGCTAGCTAGTCCTAGAGGGGATCAGATGTTTGAGATGCATGTTTAGGCTTGGGAAATAAAATGTGTCTTGTCACCATGATTATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016022
ATGTCAGGGGCTACTGGAGGTGCGATGGATGCTGGGAATTTGTTGAAACCCATGCTTGGCCGTGGAGAACTAAGATGCATCGGGGCCACCACTCTGAATGAGTACAGGAAATACATTGAGAAGGACCCTGCTTTGGAACGTAGATTTCAACAAGTATTTTGTGGACAACCATCTGTGGAAGATACAATTTCCATTTTGCATGGGGTGAAAATATCAGACAATGCTCTTGTATCAGCAGCAATTCTTTCGGATAGATACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800561.1
MSGATGGAMDAGNLLKPMLGRGELRCIGATTLNEYRKYIEKDPALERRFQQVFCGQPSVEDTISILHGVKISDNALVSAAILSDRYITERFLPDKAIDLVDEAAAKLKMEITSKPTELDEVDRAVLKLEMEKLSLKNDTAPSSKERLMKLEHDLVALKQKQGELNKQWENEKILMNRVRSIKEEIDRVNLEMEAAEREYNLNRAAELKYGTLMALQRQLEEAEKNIADYRISGKSLLREEVTDLDIAEIVSRWTGIPLSN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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