当前解析结果
SmilChr01G000290| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000290 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000290 |
| 描述 | chaperone protein ClpB3, mitochondrial-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 5678597 - 5681222 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131016044 |
|---|---|
| GeneID | 131016044 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016044 |
| 原始查询 | LOC131016044 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | chaperone protein ClpB3, mitochondrial-like |
| 产物 | chaperone protein ClpB3%2C mitochondrial-like |
| Arabidopsis | AT2G25140 (CLPB4)casein lytic proteinase B4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817052] identity=78.3; qcov=1; evalue=2.64e-71; confidence=high |
| Rice | Os02g0181900 (ClpB-m)- identity=79.6; qcov=0.993; evalue=1.65e-71; confidence=high |
| GO | GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0034605 (cellular response to heat) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016044 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057800574.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057800574.1 |
| 3 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.40000 | XP_057800583.1 |
| 4 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 0.40000 | XP_057800583.1 |
| 5 | Chloroplast thylakoid membrane | 类囊体膜 | 0.20000 | XP_057800592.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:5680421 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C60 |
Chr1:5680471 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B12,C86,C87 |
Chr1:5680506 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B106,B35,B55,C8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。