当前解析结果
SmilChr03G002891| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002891 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002891 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002891 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 45593903 - 45597355 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131016050 |
|---|---|
| GeneID | 131016050 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016050 |
| 原始查询 | LOC131016050 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | plant/protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822323]; symbol=AT3G27050; hit=AT3G27050; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | plant/protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822323]; symbol=AT3G27050; hit=AT3G27050; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT3G27050 (AT3G27050)plant/protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822323] identity=64.6; qcov=0.972; evalue=2.15e-78; confidence=high |
| Rice | Os11g0488600- identity=54.6; qcov=0.967; evalue=1.49e-58; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016050 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057800581.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057800581.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057800581.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057800581.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057800581.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:45594129 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 21 | A1,A20,B107,B108,B109,B120,B139,B3,B47,B56,B58,B60,B63,B95,B96,C22,C41,C56,C57,C76,C79 |
Chr3:45595565 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B108,B73,C23,C60 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。