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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002896`

染色体: Chr03 坐标: 45692898-45694761 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002896`
名称	SmilChr03G002896
描述	B2 protein
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	45692898 - 45694761 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016055`
GeneID	`131016055`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016055`
原始查询	`LOC131016055`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	B2 protein
产物	B2 protein
Arabidopsis	`AT3G27090` (AT3G27090) DCD (Development and Cell Death) domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822327] identity=65.1; qcov=0.993; evalue=3.21e-131; confidence=high
Rice	`Os05g0498700` - identity=55.6; qcov=1.05; evalue=7.76e-114; confidence=high
GO	GO:0034976 (response to endoplasmic reticulum stress)
KEGG	-
Pfam	PF10539 (Dev_Cell_Death)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016055

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057800593.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057800593.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.80000	`XP_057800593.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057800593.1`
5	P-body	P-body	0.40000	`XP_057800593.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:45692942`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr3:45692991`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,C25,C8
`Chr3:45692993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr3:45693019`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B69,B95,C59,C81
`Chr3:45693054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr3:45693084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	A6,B11,B124,B126,B132,B33,B64,B74,B98,C24,C25,C30,C54,C8,C84,C87,D4
`Chr3:45693142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B64,C24
`Chr3:45693144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C58,C78,C85
`Chr3:45693219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:45693227`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	A13,B111,B14,B17,B45,B61,B64,B69,B73,B84,B89,C13,C17,C55,C6,C60,C75,C80,C84,D10,D11
`Chr3:45693318`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	118	A1,A11,A13,A14,A18,A2,A20,A5,A6,A8,B10,B101,B107,B108,B109,B11,B112,B115,B117,B119,B12,B123,B124,B127,B130,B131,B132,B133,B134,B136,B138,B139,B140,B16,B18,B19,B20,B23,B26,B29,B34,B37,B38,B4,B40,B42,B44,B45,B47,B49,B5,B52,B53,B58,B66,B67,B69,B7,B70,B78,B79,B81,B82,B83,B85,B86,B88,B91,B92,B93,B98,C1,C10,C11,C12,C14,C16,C17,C2,C20,C23,C24,C25,C29,C3,C30,C31,C34,C35,C37,C38,C40,C45,C46,C47,C48,C49,C52,C54,C55,C56,C58,C59,C60,C61,C67,C71,C74,C75,C76,C81,C86,C87,C9,D11,D3,D5,D6
`Chr3:45693322`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	120	A1,A11,A13,A14,A18,A2,A20,A5,A6,A8,B10,B101,B107,B108,B109,B11,B112,B114,B115,B117,B119,B12,B123,B124,B126,B127,B130,B131,B132,B133,B134,B136,B138,B139,B140,B16,B18,B19,B20,B23,B26,B29,B32,B34,B37,B38,B4,B40,B42,B44,B45,B47,B49,B5,B52,B53,B58,B66,B67,B69,B7,B70,B78,B79,B81,B82,B83,B85,B86,B88,B91,B92,B93,B98,C1,C10,C11,C12,C14,C16,C17,C2,C20,C23,C24,C25,C29,C3,C30,C31,C34,C35,C37,C38,C40,C45,C46,C47,C48,C49,C52,C54,C55,C58,C59,C60,C61,C67,C71,C74,C75,C76,C81,C86,C87,C9,D11,D3,D5,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800593.1

300 aa

150

300

Dev_Cell_Death

PF10539 Dev_Cell_Death 168-294 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800593.1`	Pfam	`PF10539`	Dev_Cell_Death	Domain	168	294	1.4e-39	135.5	Development and cell death domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944610.1
ATGGAGCATAGCTTTTGGCAGCTGGGCGACGAGCTGCGAGGACAGTCTAAAGTCTCCAAGGATCAATAATGGTTGGTGGCGGCTTCAAGATTGGCCGAGCAGACAAGGTCAAAGCCTAAGCGAAGGATCAATCTAGATCTCTCGAAGACTGCTACTGAATTCAGGCCCAGGGGTACTTCTGGTTTTCAGGAAGATAACAAGTTTGAGAGTTTCAATTTCAACATGTTAAACATGGAGCCAAGGCTGAACGAGAACGTGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016055
ATGGAGCATAGCTTTTGGCAGCTGGGCGACGAGCTGCGAGGACAGTCTAAAGTCTCCAAGGATCAATAATGGTTGGTGGCGGCTTCAAGATTGGCCGAGCAGACAAGGTCAAAGCCTAAGCGAAGGATCAATCTAGATCTCTCGAAGACTGCTACTGAATTCAGGCCCAGGGGTACTTCTGGTTTTCAGGAAGATAACAAGTTTGAGAGTTTCAATTTCAACATGTTAAACATGGAGCCAAGGCTGAACGAGAACGTGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800593.1
MEHSFWQLGDELRGQSKVSKDQXWLVAASRLAEQTRSKPKRRINLDLSKTATEFRPRGTSGFQEDNKFESFNFNMLNMEPRLNENVTKTSFSNDIYNMNAVYQNPNISSMGNISGSKYNNINPMKESNNGHINNHNTKDDAINSNGAADKRFKILLAAETLPRNEVLGGYIFVCNNDTMXEDLKRQLFGLPPRYRDSVRAITPGLPLFLYNYTTHQLHGIFEATAFGGSNIDPTAWEDKKCRGQSRFPAQVRVRAKKPCN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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