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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002900`

染色体: Chr03 坐标: 45718009-45723274 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002900`
名称	SmilChr03G002900
描述	sulfite oxidase
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	45718009 - 45723274 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016059`
GeneID	`131016059`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016059`
原始查询	`LOC131016059`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sulfite oxidase
产物	sulfite oxidase
Arabidopsis	`AT3G01910` (SOX) sulfite oxidase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820118] identity=76.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0530400` (OsMCP) - identity=76; qcov=0.985; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0016491 (oxidoreductase activity); GO:0030151 (molybdenum ion binding)
KEGG	smil00920 (Sulfur metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00174 (Oxidored_molyb); PF03404 (Mo-co_dimer)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016059

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057800597.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057800597.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057800597.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057800597.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800597.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:45718371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B73
`Chr3:45718926`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr3:45720674`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	167	A10,A11,A13,A16,A18,A19,A2,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A8,B10,B100,B102,B103,B105,B107,B11,B110,B111,B113,B114,B115,B117,B119,B12,B120,B122,B123,B124,B125,B127,B128,B129,B13,B130,B133,B134,B135,B137,B138,B140,B15,B17,B18,B19,B2,B26,B28,B30,B32,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B42,B43,B45,B47,B48,B50,B51,B53,B57,B58,B61,B62,B63,B64,B66,B67,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B94,B98,B99,C1,C11,C12,C15,C16,C17,C18,C2,C20,C21,C22,C27,C29,C3,C30,C31,C34,C36,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C50,C51,C52,C53,C58,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C73,C75,C77,C78,C8,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D2,D3,D6,D7,D8
`Chr3:45720675`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	156	A10,A11,A13,A16,A19,A2,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A8,B10,B100,B102,B103,B105,B107,B11,B110,B111,B113,B114,B115,B117,B119,B12,B120,B122,B123,B124,B125,B127,B128,B129,B13,B130,B133,B134,B135,B137,B140,B17,B19,B2,B26,B28,B30,B32,B35,B36,B37,B38,B4,B42,B43,B45,B47,B48,B50,B53,B57,B58,B61,B62,B63,B64,B66,B67,B71,B74,B75,B76,B77,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B92,B94,B98,B99,C1,C11,C12,C15,C16,C18,C2,C20,C21,C22,C27,C29,C3,C30,C31,C34,C36,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C50,C51,C52,C53,C58,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C73,C77,C78,C8,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D2,D3,D6,D7,D8
`Chr3:45720695`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A13,B52,C60
`Chr3:45720695`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A13,B52,C60
`Chr3:45720849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr3:45720940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr3:45721043`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr3:45722631`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A4
`Chr3:45722631`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr3:45722876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800597.1

393 aa

196

393

Oxidored_molyb

Mo-co_dimer

PF00174 Oxidored_molyb 53-235 aa PF03404 Mo-co_dimer 260-387 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800597.1`	Pfam	`PF00174`	Oxidored_molyb	Domain	53	235	2.3e-54	184.2	Oxidoreductase molybdopterin binding domain
`XP_057800597.1`	Pfam	`PF03404`	Mo-co_dimer	Domain	260	387	1.6e-37	129.3	Mo-co oxidoreductase dimerisation domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944614.1
TTTGGAAATACTAGGAGTAATAAATTTCAAATAATAGTCGCATTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTGTTTGTGAAAAACAATTGCCGCATTGTTAAAAGAGCGGAACCAATGTTGCAAAACCAACCCATAGAATTGTAGGATAAGCTACGGTCACACGTTGGTGGCAAATACCATTCTCACAGCCGCCTTCAATCACCATTAATCCACTGTAAAACCTCTAAGTGGGACCCTCTCGTGACTCTTGTCAGATATACGAGAAACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016059
ATGCCTGGATTGAGGGGACCTTCTGATTACTCGCAGGAACCTCCGCGTCACCCTTCTCTCGCAATTAATTCCAAGGAACCTTTTAATGCTGAGCCGCGGAGAAAAGATTTAGTTTCATCTTACATTACGCCCGTGGAGTTCTTCTACAAGAGGAACCATGGTCCAATTCCAGTTGTGGATGACTTAGACAAATATAGTGTTTCTATCACTGGTCTAAGAGGAAGGGCCATAGAACTGTTCATGAAAGATATTTGGAAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800597.1
MPGLRGPSDYSQEPPRHPSLAINSKEPFNAEPRRKDLVSSYITPVEFFYKRNHGPIPVVDDLDKYSVSITGLRGRAIELFMKDIWKLPKYNVTATLQCAGNRRTAMSKTRPVKGVGWDVAAIGNAVWGGAKLADVLALVGIPNCSRATPSGQKHVEFVSIDKCKEENGGPYTASIPLLQATNPESDVLLAYEMNGETLNRDHGYPLRVIVPGVIGARSVKWLDSINIVVEECQGFFTQRDYKMFPPSVDWNNISWPTRRP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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