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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002905`

染色体: Chr03 坐标: 45805289-45808881 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002905`
名称	SmilChr03G002905
描述	chloride channel protein CLC-a-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	45805289 - 45808881 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016074`
GeneID	`131016074`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016074`
原始查询	`LOC131016074`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chloride channel protein CLC-a-like
产物	chloride channel protein CLC-a-like
Arabidopsis	`AT5G40890` (CLC-A) chloride channel A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834090] identity=77; qcov=0.976; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0876100` (OsCBSCLC1) - identity=52.3; qcov=0.977; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005247 (voltage-gated chloride channel activity); GO:0006821 (chloride transport); GO:0009671 (nitrate:proton symporter activity); GO:0009705 (plant-type vacuole membrane); GO:0043231 (intracellular membrane-bounded organelle); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00571 (CBS); PF00654 (Voltage_CLC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016074

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057800631.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057800631.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057800631.1`
4	Secretory vesicle	Secretory vesicle	0.20000	`XP_057800631.1`
5	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057800631.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:45805760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B73,C54
`Chr3:45806380`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr3:45806966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C18
`Chr3:45807179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr3:45807331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr3:45807520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C8
`Chr3:45807566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr3:45807591`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	43	A1,A10,B108,B112,B117,B119,B129,B130,B135,B136,B139,B18,B23,B25,B30,B32,B35,B37,B45,B48,B49,B61,B64,B66,B67,B68,B83,B85,B88,B95,C19,C29,C41,C43,C45,C49,C55,C56,C6,C61,C77,C85,D7
`Chr3:45807596`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	44	A1,A10,A7,B108,B112,B117,B129,B130,B135,B136,B139,B18,B23,B25,B30,B32,B35,B37,B45,B48,B49,B61,B64,B66,B67,B68,B83,B85,B88,B95,C19,C29,C41,C43,C45,C49,C55,C56,C6,C61,C74,C77,C85,D7
`Chr3:45807619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C45,C50
`Chr3:45807718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr3:45807763`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800631.1

790 aa

395

790

Voltage_CLC

CBS

PF00654 Voltage_CLC 148-562 aa PF00571 CBS 719-771 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800631.1`	Pfam	`PF00654`	Voltage_CLC	Family	148	562	3.2e-74	250.9	Voltage gated chloride channel
`XP_057800631.1`	Pfam	`PF00571`	CBS	Domain	719	771	5e-06	27.5	CBS domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944648.1
GAATTGCTTCTTCAAGTGCAGTCTCCAAATCATAGATTAACCTTAACAATTAATGTACTCCCATCAAACCTATATCTTCAAATTCAAACCTACCTTGGAGATATTCTTCTGTACATTAAATATAATTAATCTAAAATATTGAAGCCTCTTCCAGTAATTAATATTAATAGGAACAATCATCCTTGGCAAGAAGACAATTCTGTCCACTGCCCAAAACAAGTAATATTATTTGTATATATATTCCAAAATCAGAGGAACAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016074
ATGGAGGAGCTCAACAGGTTTGTAGAATCAGAAGCAGAAAGCATAGAAAGGAATCAACAAGAATATGATGATGTTAATGACCCAGAAAGCAATGATCTTCACCTGCCTCTGCTCAAGAGAAACAGAACCCTCTCATCAACCCCACTCGCCATTGTTGGAACCAAGGTTTCTCACATTGAGAGCTTGGATTATGAGATCAATGAGAATGATCTGTTCAAGCAAGATTGGAGAAGCAGATCAAAAGTTCAAGTACTGCAGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800631.1
MEELNRFVESEAESIERNQQEYDDVNDPESNDLHLPLLKRNRTLSSTPLAIVGTKVSHIESLDYEINENDLFKQDWRSRSKVQVLQYILMKWLLAFLVGLLTGGIATLINLAVENITGYKFLAVVKYIDQERYMMGFLVMAGANFFLTLVASLLVVLFAPTAAGPGIPEIKAYLNGIDTPDMFGASTLIVKIIGSIGAVAAGLDLGKEGPLVHIGSCIASLLGQGGPDNYRIKWRWLRYFNNDRDRRDLITCGSSSGVCA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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