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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002953`

染色体: Chr03 坐标: 46249131-46253973 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002953`
名称	SmilChr03G002953
描述	uncharacterized protein At1g51745
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	46249131 - 46253973 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016077`
GeneID	`131016077`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016077`
原始查询	`LOC131016077`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Tudor/PWWP/MBT superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821075]; symbol=AT3G03140; hit=AT3G03140; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Tudor/PWWP/MBT superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821075]; symbol=AT3G03140; hit=AT3G03140; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G03140` (AT3G03140) Tudor/PWWP/MBT superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821075] identity=35.3; qcov=1.16; evalue=3.66e-105; confidence=medium
Rice	`Os02g0700000` - identity=77.9; qcov=0.183; evalue=7.12e-56; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00855 (PWWP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016077

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800634.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800634.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800634.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800634.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057800634.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:46251775`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B140,C37,C38
`Chr3:46252933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr3:46253105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B48
`Chr3:46253108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B48
`Chr3:46253125`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B48
`Chr3:46253128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,C20
`Chr3:46253207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr3:46253500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C33
`Chr3:46253540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,C87
`Chr3:46253629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr3:46253702`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:46253815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800634.1

667 aa

334

667

PWWP

PF00855 PWWP 15-95 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800634.1`	Pfam	`PF00855`	PWWP	Domain	15	95	6.9e-10	40.0	PWWP domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944651.1
GTAATTTCTTTAAATGGGCTCTCATCCAAATCAAACTATCTATTCCGTGCGCGGGCGATGCTAAAGTGAGCCGGCAGTGGAGAGAGCCTTAACGCTCACGCACGCTATGCGTATGACAGACACAACTCGTGCAACTGAAGCGCAGAGTCAACACTCAACCAGCACAAAATCGACTCACCTATACATACACCTATACATACACTTCCGCTCTATATATCAAATTCCCCTCTTCCTCGATTCCAACCGCCAATCAATCCCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016077
ATGGGTAGCTCAGAAACGGGAGGAGTGGTGGATTGTAGTGTGGGGAGTATAGTTTGGGTCCGACGACGAAATGGGTCTTGGTGGCCAGGAAAAATACTTGGGCCTGAAGAGCTTTCATCGTCTCATATAACATCCCCGCGATCAGGAACTCCAGTCAAGCTTCTAGGGAGGGAGGATGCCAGTGTGGACTGGTACAACTTGGAGAAATCAAAACGTGTAAAGGCTTTCCGATGTGGTGAGTTTGATGACTGCATAGAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800634.1
MGSSETGGVVDCSVGSIVWVRRRNGSWWPGKILGPEELSSSHITSPRSGTPVKLLGREDASVDWYNLEKSKRVKAFRCGEFDDCIERAEAAQGMPPKKREKYARREDAILHALELERQLLEKKYGKSGNSSNGRRKSPDAVTSSECLENGAGNRIDPGSDQLSERLGLSVVEKNGTDQHPCEEMVKDVNQPSGDDDSAGALPRMRGLQDLGLRTTPPTREEHSGVAISRAKRSRNAYLTYDSGDCSNDNQTLTTQMEIPV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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