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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002974`

染色体: Chr03 坐标: 46539325-46543644 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002974`
名称	SmilChr03G002974
描述	autophagy-related protein 13a
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	46539325 - 46543644 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016081`
GeneID	`131016081`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016081`
原始查询	`LOC131016081`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	autophagy-related protein 13a
产物	autophagy-related protein 13a
Arabidopsis	`AT3G49590` (ATG13) Autophagy-related protein 13 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824121] identity=45.9; qcov=1; evalue=9.55e-142; confidence=high
Rice	`Os02g0644500` (OsATG13a) - identity=36.7; qcov=0.977; evalue=1.53e-84; confidence=medium
GO	GO:0000045 (autophagosome assembly); GO:0000407 (phagophore assembly site); GO:0000423 (mitophagy); GO:0005829 (cytosol); GO:0019898 (extrinsic component of membrane); GO:0034497 (protein localization to phagophore assembly site); GO:0034727 (piecemeal microautophagy of the nucleus); GO:1990316 (Atg1/ULK1 kinase complex)
KEGG	smil04136 (Autophagy - other - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF10033 (ATG13)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016081

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057800637.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.80000	`XP_057800637.1`
3	Autophagic vesicle	Autophagic vesicle	0.60000	`XP_057800637.1`
4	Autophagosome	Autophagosome	0.40000	`XP_057800637.1`
5	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057800637.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:46539593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr3:46539681`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr3:46539752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,B50,B60
`Chr3:46539753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C59
`Chr3:46541285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25
`Chr3:46541768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr3:46541815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr3:46541872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B53,C38,C42
`Chr3:46542331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr3:46542514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B48,B74
`Chr3:46542676`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B10,B7,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800637.1

605 aa

302

605

ATG13

PF10033 ATG13 19-218 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800637.1`	Pfam	`PF10033`	ATG13	Family	19	218	4.2e-32	112.4	Autophagy-related protein 13

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944654.1
AAAGATTAATGGCTGTTTAGAAAGAGAAGTGACTAATTAAACTTACTTTTAATGATAAGATTGATTATAAACTATAACATGTCATCAGCACCTCTCTCTCTCTCTCTCCTGCTGCTACCAGTATACGCAATCTTTCTCTCTCTAAATTACGCCATTTTGATCTAAAACACTCCATCTTTTCAAGGAATTTTGCTCTCTCAAGTATGCATAGAATATACAGAGGTATGCATATGAGAGAGGATGTTTCTAGAAAAATATAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016081
ATGGATTTGCACAGCTATCCTCATGGTGAACATGGAAGATTTGAGCAAATATTTAATCAGTTTCTTCTAAAGAGCTTGCACATAATTTTGGATTCAAGGGTTCCGATGAACCGGCCGCCTAGCCGGGGAGGGGAAATAAGGAAGAGCGATAGATGGTTTAATTTAGTGTTGGGGGATCGCCCTGCAGCTATGGATAGCTTAAGTTTTTGGAATAGAAGTTTGATGGAACCTATGGTGATCGATATTATACTTGTTCAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800637.1
MDLHSYPHGEHGRFEQIFNQFLLKSLHIILDSRVPMNRPPSRGGEIRKSDRWFNLVLGDRPAAMDSLSFWNRSLMEPMVIDIILVQELRDSLSEHDSRSSLTTEMFAETVIERWVVQYEYQRSMAPQIGDAFYKKTYKKSIILLRSVYSMLRLLPAYKAFRKQISFKQNCDFEINYKICSFGSPLSRSEEESMKNYSFIPIDAQQGRLSVSVMYREDLSDFNLDSCVSHPIEIITDYVGSPLTDPMRAFPCTSSEKGHST...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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