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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002979`

染色体: Chr03 坐标: 46624053-46625807 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002979`
名称	SmilChr03G002979
描述	pathogenesis-related thaumatin-like protein 3.5
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	46624053 - 46625807 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016109`
GeneID	`131016109`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016109`
原始查询	`LOC131016109`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pathogenesis-related thaumatin-like protein 3.5
产物	pathogenesis-related thaumatin-like protein 3.5
Arabidopsis	`AT5G24620` (AT5G24620) Pathosis-related thaumatin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832533] identity=73.1; qcov=0.827; evalue=7.46e-130; confidence=high
Rice	`Os09g0536400` - identity=57.3; qcov=0.754; evalue=3.24e-83; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00314 (Thaumatin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016109

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057800700.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057800700.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800700.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800700.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800700.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:46624177`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	A11,A18,A23,A24,B107,B24,B28,B3,B46,B5,B53,B54,B55,B62,B68,B94,C18,C2,C65,C78,C79,C87,D2,D3
`Chr3:46624179`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	A11,A18,A23,A24,B107,B24,B28,B3,B46,B5,B53,B54,B55,B62,B68,B94,C18,C2,C65,C78,C79,C87,D2,D3
`Chr3:46624512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr3:46624513`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,D7
`Chr3:46624514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C59
`Chr3:46624535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,C48
`Chr3:46624580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B15,C22
`Chr3:46624588`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B126
`Chr3:46624588`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B126
`Chr3:46624598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr3:46624618`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,B75,C33,C55
`Chr3:46624619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800700.1

301 aa

150

301

Thaumatin

PF00314 Thaumatin 28-243 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800700.1`	Pfam	`PF00314`	Thaumatin	Domain	28	243	2.3e-81	273.2	Thaumatin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944717.1
GATTTAAAATAGAATTAAGGCAAGGCATATGATGAGGAATTTTTCAAAAACATATGTGCTCATGCTAAAGCAAGGAATTTCTTGTGGTTGAGGCCATCCAAAATTCAAGAAATGCTAAACCCAAATCCATAATCTTGCGGCTGATGAATTCTGCAAAGCAACGTAGCTCTTCCTCAATGTCGTACAAATACGTAACACCACCTATTTCCACCTCTACTCATGGCGTCTCGGCCGTTTCTCATCTCTTTAGCAATTTCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016109
ATGGCGTCTCGGCCGTTTCTCATCTCTTTAGCAATTTCCACCTTCTTCACCAGCTCTTTTGCTTGCACATTTGTGATCACCAACAGCTGCCCTTTCACGATATGGCCCGGCACCCTGTCCGGTTCAGGCACACCGCCTCTCCCGGCAACGGGGTTCCAATTGGATTCCGGCCAGAGCATCACCATTCCGACTACTCCGGGATGGTCTGGCCGGATGTGGGCCAGAACCGGCTGCACATTTGATGTGACCGGTTCTGGCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800700.1
MASRPFLISLAISTFFTSSFACTFVITNSCPFTIWPGTLSGSGTPPLPATGFQLDSGQSITIPTTPGWSGRMWARTGCTFDVTGSGSCQTGDCGGRLECNGIGATPPASLFEITLGVGDQKDFYDVSIVDGYNLPLAAVPRHGGCNATGCVQDINMGCPKELQVIGNEGGEGGGVVACKSACEAFGLDQYCCSGEFANPTTCRPSFYSGIFKRACPTAYSYAFDDGTSTFTCKASLYNIIFCPNSGMRIIDGGLQTPAVE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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