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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002933`

染色体: Chr03 坐标: 46067342-46070591 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002933`
名称	SmilChr03G002933
描述	binding partner of ACD11 1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	46067342 - 46070591 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016110`
GeneID	`131016110`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016110`
原始查询	`LOC131016110`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	binding partner of ACD11 1
产物	binding partner of ACD11 1
Arabidopsis	`AT4G17720` (AT4G17720) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827493] identity=61.5; qcov=0.986; evalue=3.57e-114; confidence=high
Rice	`Os04g0594400` - identity=53.3; qcov=1.09; evalue=4.5e-107; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016110

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057800701.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057800701.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057800701.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800701.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800701.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:46069707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr3:46069917`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B11,B89
`Chr3:46070235`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C48
`Chr3:46070238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr3:46070387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800701.1

290 aa

145

290

RRM_1

PF00076 RRM_1 7-66 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800701.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	7	66	1.5e-07	31.9	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944718.1
CCTTTTGAGAAAAATAAAAATGGCAGATTTAGTAGGAGCGTTTAATTCCACGTGATGACGCAACGCGTGGACGCCCAAAAAGCGGGTGCTCTTCTGTGCGGTTCAGTCCAATTCCTTGTGATGCGCCTTCAAATTCCCATGAAAAACTTTTTGAGAGAGTCGCATCAGTAATTTAACTGTAGAGAAAACTGGAAACCCCAAACACTTTTCTGCCTTCATTTCTAAGACTCATAAATTAATAATCACATCTCCAACTCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016110
ATGACGACCAGGACTGTGAAAGTGAGCAATGTGTCGCTGAGTGCAACAGAACAAGACATCCAGGAGTTCTTTTCCTTCTCTGGGGTAATTCAATATGTTGAAATGAAAAGTGAAAATGAGAGATCTCAATCTGCGTATGTCACTTTCAAGGATGCTCAGGGTGCAGAAACTGCTGTTCTTCTTTCGGGAGCCACGATAGTGGACCAGTCAGTCACCATTGCCCTTGAACCAAACTATACACTGCCAGCATCAGCAGCAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800701.1
MTTRTVKVSNVSLSATEQDIQEFFSFSGVIQYVEMKSENERSQSAYVTFKDAQGAETAVLLSGATIVDQSVTIALEPNYTLPASAAASTASQGDTAAGGVAAAAQKAEDVVSGMLAKGFILGKDALNRAKSFDERHQLISTASAKVASLDQKIGLSEKITVGATIVNDKVKEVDQKFQVSEKTKTAFAAAEQTVSSAGTAIMKNRYILTGTTWVTGAFNRVSKAAGDVGQKTLEKVAEEEQGRNEAQGYTQLHTTDSPKA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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