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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002947`

染色体: Chr03 坐标: 46204409-46206841 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002947`
名称	SmilChr03G002947
描述	probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	46204409 - 46206841 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016128`
GeneID	`131016128`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016128`
原始查询	`LOC131016128`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
产物	probable NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12
Arabidopsis	`AT3G03100` (AT3G03100) NADH:ubiquinone oxidoreductase, 17.2kDa subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821104] identity=79.2; qcov=0.981; evalue=3.76e-93; confidence=high
Rice	`Os10g0579300` - identity=78.2; qcov=0.994; evalue=8.04e-90; confidence=high
GO	GO:0005747 (GO:0005747); GO:0006979 (response to oxidative stress); GO:0016020 (membrane); GO:0032981 (mitochondrial respiratory chain complex I assembly)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05071 (NDUFA12)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016128

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057800730.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057800730.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.80000	`XP_057800730.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800730.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800730.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:46206280`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B76,C60,C76
`Chr3:46206461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:46206474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800730.1

157 aa

157

NDUFA12

PF05071 NDUFA12 49-154 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800730.1`	Pfam	`PF05071`	NDUFA12	Family	49	154	1.1e-25	91.0	NADH ubiquinone oxidoreductase subunit NDUFA12

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944747.1
GTAATCACTATCCGGCCCAGGAAACCCAATTGATTTGGACGGTGGCCTGAATTTCAGTTTTGCAGCTTCTTATGTTTCATTGAGGAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGATTGCGAGAGGTAGAAATGGCAGCGGTGGTGAGAGGCGCGATGAAATTGATTAAAGAAAAAGGAATTGGAGGTTTCTTCAGGGAGATTCGTGAAGAAGGATACCTGAGTGCGCTTTTGGATGGAAATCTCATGCAAACAAAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016128
ATGGCAGCGGTGGTGAGAGGCGCGATGAAATTGATTAAAGAAAAAGGAATTGGAGGTTTCTTCAGGGAGATTCGTGAAGAAGGATACCTGAGTGCGCTTTTGGATGGAAATCTCATGCAAACAAAAATTCACAATATCGGTGCAACAGTAGTGGGTGTTGACAAATTTGGCAATAAGTACTATGAGAAACTTGGAGACACTCAATATGGGAGACATAGGTGGGTTGAGTATGCTTCCAAGGACCGTTACAATGCCTCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800730.1
MAAVVRGAMKLIKEKGIGGFFREIREEGYLSALLDGNLMQTKIHNIGATVVGVDKFGNKYYEKLGDTQYGRHRWVEYASKDRYNASQVPPEWHGWLHHITDHTGDELLLLKPTRYGVEHKQNFSGEGDEYIYHSKGHALNPGQRDWTRYQTWQPKKP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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