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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003012`

染色体: Chr03 坐标: 47021215-47022940 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003012`
名称	SmilChr03G003012
描述	peroxidase 5-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	47021215 - 47022940 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016163`
GeneID	`131016163`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016163`
原始查询	`LOC131016163`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peroxidase 5-like
产物	peroxidase 5-like
Arabidopsis	`AT1G05260` (RCI3) Peroxidase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837028] identity=48.1; qcov=0.991; evalue=4.78e-99; confidence=high
Rice	`Os03g0121200` (prx33) - identity=56.2; qcov=0.985; evalue=1.57e-123; confidence=high
GO	GO:0004601 (peroxidase activity); GO:0006979 (response to oxidative stress); GO:0009505 (plant-type cell wall); GO:0009506 (plasmodesma); GO:0020037 (heme binding); GO:0042744 (hydrogen peroxide catabolic process)
KEGG	smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00141 (peroxidase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016163

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057800772.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057800772.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800772.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800772.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800772.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:47021858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,A25,B87,C25,C70
`Chr3:47021864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:47022163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,C31
`Chr3:47022415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:47022444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B52,C61
`Chr3:47022469`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B58,B95,C22,C31
`Chr3:47022474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:47022526`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,B76
`Chr3:47022551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr3:47022572`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A21,B23
`Chr3:47022572`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A21,B23
`Chr3:47022589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800772.1

325 aa

162

325

peroxidase

PF00141 peroxidase 42-287 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800772.1`	Pfam	`PF00141`	peroxidase	Domain	42	287	1.3e-85	287.7	Peroxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944789.1
ACAACGTCTACAAAATAAAATATTAGCAGCAAACTACGCGTCGACAATACTTAATCCATTTGTCGTATCTTCCTCATATATTTACTTCTTTTCATCTGCTGCACAAGTTAAACGACATTCACAGCGAGTTTCCTACTCATTCGCCACTAAATGTGATAGAAAATTCGGACAATGCACCGATTTTTTTGTCTATATATCTTGTTGCCTTTTCTTGTAATGGAAGAAGCCATAGACTAAAGCAAACCTCAAAAAGCAAGGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016163
ATGAGTTCTAAACTGCTTCAAACCCTCACTACAGCACTCCTATGTTTCTGCATTGTCAAGACAGCAACAGCTCAGCTTCAAGTGGGGTTCTATCAACGTTCGTGTGGCTTTGCTGAGTTCTTTGTGAAGCAACAAGTTCGAGCTGCATTCATCAATGACAACGGAGTTGCTGCAGGCCTTGTTAGGCTTCATTTTCATGACTGTTTTGTGATGGGCTGTGATGGCTCTGTGCTGCTAGACTCCACCAAATCAAACACGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800772.1
MSSKLLQTLTTALLCFCIVKTATAQLQVGFYQRSCGFAEFFVKQQVRAAFINDNGVAAGLVRLHFHDCFVMGCDGSVLLDSTKSNTAEKDSPPNNPSLRGFEAVDSIKTILEAMCPGVVSCADILAFAARDSIEITGGLGYDVPAGRRDGRVSLASEALKNLPPPTLDVNQLTNAFANKGLTQEEMVTLSGAHTLGRSHCTSFTNRLYNFNSNSSIDPTLDAMYASQLRRQCPQGGDASLVVPMEATPATADVAYYRGVA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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