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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003048`

染色体: Chr03 坐标: 47385347-47389171 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003048`
名称	SmilChr03G003048
描述	probable glutathione peroxidase 4
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	47385347 - 47389171 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016194`
GeneID	`131016194`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016194`
原始查询	`LOC131016194`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable glutathione peroxidase 4
产物	probable glutathione peroxidase 4
Arabidopsis	`AT2G48150` (GPX4) glutathione peroxidase 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819427] identity=75.3; qcov=1; evalue=4.01e-97; confidence=high
Rice	`Os03g0358100` (OsGpx2) - identity=73.7; qcov=0.982; evalue=8.44e-93; confidence=high
GO	GO:0004602 (glutathione peroxidase activity); GO:0006979 (response to oxidative stress)
KEGG	smil00480 (Glutathione metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00255 (GSHPx); PF00578 (AhpC-TSA); PF08534 (Redoxin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016194

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057800809.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057800809.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057800810.1`
4	Mitochondrion intermembrane space	Mitochondrion intermembrane space	0.20000	`XP_057800810.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800809.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:47385861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr3:47385876`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr3:47388796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr3:47388857`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B87,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800809.1

182 aa

182

AhpC-TSA

Redoxin

GSHPx

PF00578 AhpC-TSA 11-74 aa PF08534 Redoxin 11-151 aa PF00255 GSHPx 12-120 aa

XP_057800810.1

170 aa

170

AhpC-TSA

Redoxin

GSHPx

PF00578 AhpC-TSA 11-74 aa PF08534 Redoxin 11-152 aa PF00255 GSHPx 12-120 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800809.1`	Pfam	`PF00578`	AhpC-TSA	Domain	11	74	2.2e-08	34.8	AhpC/TSA family
`XP_057800809.1`	Pfam	`PF08534`	Redoxin	Domain	11	151	2.3e-08	34.7	Redoxin
`XP_057800809.1`	Pfam	`PF00255`	GSHPx	Family	12	120	6.5e-39	132.6	Glutathione peroxidase
`XP_057800810.1`	Pfam	`PF00578`	AhpC-TSA	Domain	11	74	1.8e-08	35.1	AhpC/TSA family
`XP_057800810.1`	Pfam	`PF08534`	Redoxin	Domain	11	152	1.5e-08	35.2	Redoxin
`XP_057800810.1`	Pfam	`PF00255`	GSHPx	Family	12	120	5.3e-39	132.9	Glutathione peroxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944827.1
TTCGCAAGCATATATTCCTTCCCTTATTGTCGTTTGAAATAGCAAATAAGTACTTCAAAAATAAATAAACATACAGCATAGGCGCTACTCTGGCATAAATGTGAGACCCTTTTTTTCAAACGTCGAATAAAAAACAGCTGTATAAGGTGATAAATAAATGATAAGCCTAATTTACATAATTCATGTGATCACTCAAAGCACTCTCATCCCTTTCACACTCTCATCCCAAAAATTTCAAACTTTAAATTTGCATTCAGACA...

XM_057944826.1
TGTGAGACCCTTTTTTTCAAACGTCGAATAAAAAACAGCTGTATAAGGTGATAAATAAATGATAAGCCTAATTTACATAATTCATGTGATCACTCAAAGCACTCTCATCCCTTTCACACTCTCATCCCAAAAATTTCAAACTTTAAATTTGCATTCAGACATCTATATCTATCTATCAGCTGTTGAGAGACGGAGAAAGAGGATATGGGCGCTTCTTCTTCAGTCCCAGAAAAATCTATACATGAATTTACTGTCAAGGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016194
ATGGGCGCTTCTTCTTCAGTCCCAGAAAAATCTATACATGAATTTACTGTCAAGGACAGCAAAGCTAATGATGTTAACCTGAGTATCTATAAAGGGAAAGTCTTGCTTGTTGTTAATGTCGCTTCCAAATGTGGGTTCACAAATTCAAATTATACCCAGTTGACTGATCTTTACTCGAAATACAAGGATAAAGGTTTCGAGATATTGGCCTTCCCATGCAACCAGTTCTTGTATCAAGAGCCAGGTACAAGCCAAGATGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057800809.1
MGASSSVPEKSIHEFTVKDSKANDVNLSIYKGKVLLVVNVASKCGFTNSNYTQLTDLYSKYKDKGFEILAFPCNQFLYQEPGTSQDAEQFACSRFKAEYPIFQKVKVNGPNAAPVYKFLKASKGGWFGSQIKWNFTKFLVDKDGNVIRRYATSTSPLAIEVLPPSSRSLSLSLSHEFLCQTM

XP_057800810.1
MGASSSVPEKSIHEFTVKDSKANDVNLSIYKGKVLLVVNVASKCGFTNSNYTQLTDLYSKYKDKGFEILAFPCNQFLYQEPGTSQDAEQFACSRFKAEYPIFQKVKVNGPNAAPVYKFLKASKGGWFGSQIKWNFTKFLVDKDGNVIRRYATSTSPLAIEGDIKKALGES

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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