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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G003052`

染色体: Chr03 坐标: 47411397-47412523 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G003052`
名称	SmilChr03G003052
描述	reticulon-like protein B23
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	47411397 - 47412523 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016199`
GeneID	`131016199`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016199`
原始查询	`LOC131016199`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	reticulon-like protein B23
产物	reticulon-like protein B23
Arabidopsis	`AT1G78895` (AT1G78895) Reticulon family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844227] identity=64.5; qcov=0.963; evalue=1.73e-66; confidence=high
Rice	`Os08g0225100` - identity=58.9; qcov=0.801; evalue=2.42e-49; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02453 (Reticulon)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016199

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057800817.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057800817.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057800818.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800817.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800817.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:47411779`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	102	A11,A14,A22,A23,A24,A25,A4,A5,A6,B10,B100,B104,B105,B106,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B118,B121,B122,B124,B13,B130,B132,B133,B138,B16,B20,B28,B30,B31,B32,B36,B37,B4,B44,B45,B47,B49,B58,B59,B63,B65,B66,B72,B77,B78,B83,B84,B88,B90,B92,B98,C11,C12,C13,C16,C17,C23,C25,C26,C27,C28,C30,C31,C32,C35,C39,C4,C42,C43,C44,C45,C5,C51,C52,C59,C6,C60,C62,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C75,C79,C81,C82,C9,D1,D10,D11,D3,D4,D6
`Chr3:47411806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:47411833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:47411849`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B2,B83,C59
`Chr3:47411924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,C47
`Chr3:47412200`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr3:47412275`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B52
`Chr3:47412275`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B52
`Chr3:47412360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,B48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800817.1

176 aa

176

Reticulon

PF02453 Reticulon 11-128 aa

XP_057800818.1

161 aa

161

Reticulon

PF02453 Reticulon 11-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800817.1`	Pfam	`PF02453`	Reticulon	Family	11	128	1.6e-14	54.8	Reticulon
`XP_057800818.1`	Pfam	`PF02453`	Reticulon	Family	11	131	5.4e-15	56.4	Reticulon

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944835.1
AATGAACATTGGTTTTTTTATTACGTCAACTAAACTTAAAACTCCTACTGGATTAGATCGCAACATTGAAAAGTAATATTTTAATTGAAAAACAATAAGATTCCAAAGAAGAAAATATTGAAATGTGGAAAACAGAGACAATTGTTTGCAGTTGAATGATGGTGTTGGTTGGGGCGGCCATGGGCATGATGAGCGGCACGCTCGTCTACTACCACTGCGCCTACCGTCAATCCAGCGTCGTCTCCCTCTTGGCCGACGTT...

XM_057944834.1
AGATCGCAACATTGAAAAGTAATATTTTAATTGAAAAACAATAAGATTCCAAAGAAGAAAATATTGAAATGTGGAAAACAGAGACAATTGTTTGCAGTTGAATGATGGTGTTGGTTGGGGCGGCCATGGGCATGATGAGCGGCACGCTCGTCTACTACCACTGCGCCTACCGTCAATCCAGCGTCGTCTCCCTCTTGGCCGACGTTCTCATCGTCCTCCTCTGTTCTCTCGCCATCCTCGGTCTCCTCTTCCGCCACATG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016199
ATGATGGTGTTGGTTGGGGCGGCCATGGGCATGATGAGCGGCACGCTCGTCTACTACCACTGCGCCTACCGTCAATCCAGCGTCGTCTCCCTCTTGGCCGACGTTCTCATCGTCCTCCTCTGTTCTCTCGCCATCCTCGGTCTCCTCTTCCGCCACATGAACATCGCCGTCCCCGTTGACCCCCTCCACTGGCAGATCTCCCAAGACGCCGCCTCCTCCCTCTTCGCCTGCCTCGCCAACACCCTCGGCGCCGCCGAGTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057800817.1
MMVLVGAAMGMMSGTLVYYHCAYRQSSVVSLLADVLIVLLCSLAILGLLFRHMNIAVPVDPLHWQISQDAASSLFACLANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFLKVVLCLYLLSVIGRAFSGVAVAYIGQYNYTQIPISSQNHRFYATVLLLHLSVNVFNFLFSRFNLLAHRKLLGAE

XP_057800818.1
MMVLVGAAMGMMSGTLVYYHCAYRQSSVVSLLADVLIVLLCSLAILGLLFRHMNIAVPVDPLHWQISQDAASSLFACLANTLGAAESVLRVAATGHDKRLFLKVVLCLYLLSVIGRAFSGVAVAYIGLCLYCVYAILDNSQTNNPCLGRLSVRRDGAQDNS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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